绘制活细胞中短型 NEAT1 的扩散图谱

内容形式：摘要译文

长链非编码 RNA NEAT1 是核内凝聚体，尤其是旁斑的核心组织者。尽管作为支架所必需的 NEAT1-2 亚型已得到广泛表征，但其较短亚型 NEAT1-1 的功能与动态特征仍知之甚少。由于 NEAT1-1 与 NEAT1-2 在基因组上存在重叠，长期以来，在活细胞中研究 NEAT1-1 一直受到阻碍。传统的可视化研究设计要么需要遗传敲除 NEAT1-2，从而破坏旁斑的完整性；要么使用体积较大的串联标记阵列，这可能会对 RNA 折叠和分配产生空间位阻。本文采用一种非侵入式成像策略，并利用荧光点亮适配体 biRhoBAST 对 NEAT1-1 进行扩散性分析。这种小型、高亲和力的 RNA 标签能够实现 NEAT1-1 的高对比度可视化，同时维持两种亚型及其相关核内结构的结构完整性。通过结合成像与荧光涨落光谱，我们对完整微斑和旁斑中的 NEAT1-1 进行了表征。结果表明，NEAT1-1 并非仅被限制在可见凝聚体内；相反，其中一部分在核质中呈现独特的扩散状态，可能以纳米尺度复合物的形式存在。这些发现提示，NEAT1-1 具有一种此前未被认识到、独立于主要旁斑支架的调控作用，为理解 lncRNA 亚型的功能多样性提供了新见解。

关键词：长链非编码RNA · NEAT1-1 · RNA适配体成像 · 荧光涨落光谱 · 核内扩散动力学

原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.13.724860v1?rss=1