宏基因组学揭示吡咯喹啉醌对烟草根际微生物组的剂量依赖性影响

由 root 提交于 周四, 10/15/2026 - 04:41
摘要

吡咯喹啉醌(PQQ)已知能够促进植物生长,但根际微生物组如何随PQQ浓度变化,仍缺乏充分认识。我们采用宏基因组测序,表征了0.5、1和2 mol/L PQQ处理及未处理对照下烟草根际微生物组的分类组成和功能潜力。根际微生物组主要由假单胞菌门(Pseudomonadota)和放线菌门(Actinomycetota)组成,并在不同处理间呈现出与浓度相关但非单调的差异。最显著的差异出现在1 mol/L处理下,此时α多样性在不同维度上表现出差异性变化,β多样性分析也解析出最为 distinct 的群落特征。分类组成与功能谱同步变化,其中链霉菌属(Streptomyces)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、Rhodanobacter属和溶杆菌属(Lysobacter),以及与生物合成、能量代谢、定殖和环境感知相关的功能,在该浓度下的相对丰度较高。在群落水平上未检测到广谱抗菌效应;经多重检验校正后,各处理间抗生素抗性基因丰度也无显著差异。这些发现为进一步评估PQQ在连作体系中调控根际微生物组的作用提供了基础。

吡咯喹啉醌(PQQ)已知能够促进植物生长,但根际微生物组如何随 PQQ 浓度变化,目前仍缺乏充分认识。我们采用宏基因组测序,分析了烟草根际微生物组在不同 PQQ 处理下的分类组成和功能潜力;处理浓度分别为 0.5、1 和 2 μmol/L,并设未处理对照。根际微生物组以假单胞菌门(Pseudomonadota)和放线菌门(Actinomycetota)为主,不同处理间的群落差异与浓度相关,但并非单调变化。在 1 μmol/L 处理下,观察到最显著的差异:α 多样性在不同维度上呈现差异,β 多样性分析则显示该处理具有最为独特的群落特征。分类组成和功能谱同步变化;在该浓度下,链霉菌属(Streptomyces)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、罗丹杆菌属(Rhodanobacter)和溶杆菌属(Lysobacter)相对丰度较高,与此同时,涉及生物合成、能量代谢、定殖和环境感知的功能相对丰度也较高。在群落层面未检测到广谱抗菌效应;经多重检验校正后,各处理间抗生素抗性基因丰度无显著差异。这些发现为进一步评估 PQQ 在连作系统中调节根际微生物组的作用提供了依据。

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关键词:吡咯喹啉醌 · 烟草根际微生物组 · 宏基因组测序 · 剂量依赖性效应 · 微生物群落功能

原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.08.757804v1?rss=1