家犬可能影响人类微生物群，并充当人畜共患细菌的储存宿主或预警指示物，但东南亚地区这类动态关系仍鲜为人知。本研究利用直肠拭子进行全长 16S rRNA 基因测序，分析了泰国农村楠府四个村庄中犬与犬主配对样本的微生物群，以评估微生物多样性、共有分类群及人畜共患潜力。与人类相比，犬的微生物多样性和推定病原体多样性更高，雨季尤为明显。尽管犬主配对样本中共有的细菌多于无关联个体，但总体重叠程度仍然有限，这可能与犬只自由漫游的生活方式及其更广泛的环境暴露有关。然而，志贺菌属（Shigella spp.）和肺炎克雷伯菌（Klebsiella pneumoniae）等推定人畜共患病原体的共同出现提示，犬可能是监测特定公共卫生风险的有用指示物；仍需开展进一步的靶向病原体筛查，以验证这些结果。我们的研究结果凸显了将犬纳入人畜共患病监测项目的价值，尤其是在流浪犬数量较多且人畜接触密切的地区。
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摘要
家犬可能影响人类微生物群，也可能成为人畜共患细菌的储存宿主或预警哨点，但目前对东南亚地区这类动态关系的了解仍然有限。本研究采用直肠拭子全长 16S rRNA 基因测序，对泰国农村楠府四个村庄的犬主配对样本进行微生物群分析，以评估微生物多样性、共享分类群及人畜共患风险。与人类相比，犬只的微生物多样性和推定病原体多样性更高，尤其是在雨季。尽管犬主配对个体共享的细菌多于无亲缘关系的个体，但总体重叠程度仍然有限，这可能与犬只自由游荡的生活方式及其更广泛的环境暴露有关。然而，志贺菌属（*Shigella* spp.）和肺炎克雷伯菌（*Klebsiella pneumoniae*）等推定人畜共患病原体的共同出现表明，犬只可能有助于监测特定公共卫生风险；仍需开展有针对性的病原体筛查以验证这些结果。我们的研究结果凸显了将犬只纳入人畜共患病原体监测计划的价值，尤其是在流浪犬数量较多且人畜接触密切的地区。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
已声明的资助信息
欧洲地平线计划 BCOMING 项目
法国国家研究署（ANR-19-ASIE-0002）
比利时科学研究基金会，R.8001.l 9
泰国国际合作署
版权
本预印本的版权归作者/资助方所有；其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。
本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议开放获取。
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发布于 2026 年 10 月 08 日。
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探索东南亚的犬主微生物群与细菌性病原体
Pauline Van Leeuwen、
Anamika Kritiyakan、
Serge Morand、
Areeya Kriengudom、
Alix Nicolas、
Michel De Garine-Wichatitsky、
Johan Michaux
bioRxiv
2026.10.07.757238；
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.10.07.757238
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探索东南亚的犬主微生物群与细菌性病原体
Pauline Van Leeuwen、
Anamika Kritiyakan、
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Alix Nicolas、
Michel De Garine-Wichatitsky、
Johan Michaux
bioRxiv
2026.10.07.757238；
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https://doi.org/10.64898/2026.10.07.757238
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关键词：犬-人微生物群 · 人畜共患病原体 · 全长16S rRNA测序 · 微生物多样性 · 人畜共患病监测
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.07.757238v1?rss=1