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细胞会根据环境变化调节其内部回路。因此,使细胞暴露于变化的条件下,可以用于探测细胞内部回路的内在动力学。代谢网络就是这类回路的例子,因为环境条件发生短暂改变时,代谢通量会动态调整。现有的大多数理论框架侧重于细胞代谢稳态,并未考虑代谢通量变化的动力学过程。本研究将控制理论中的传递函数分析应用于小鼠卵母细胞,分析氧耗竭及恢复这一动态扰动下线粒体和细胞质中 NADH 氧化通量的变化。我们观察到,氧恢复时细胞质中的 NADH 氧化通量出现超调,而线粒体中的 NADH 氧化通量并无此现象。代谢扰动实验和传递函数分析表明,这种细胞质 NADH 超调源于线粒体与细胞质 NADH 循环之间的耦联。超调程度由相互竞争的时间尺度决定,这些时间尺度与乳酸和丙酮酸同培养液的交换速率,以及乳酸脱氢酶催化二者相互转化的速率有关。将控制理论应用于这些数据,可以推断丙酮酸和乳酸的交换与转化速率,并据此预测乳酸对线粒体呼吸的贡献。本研究表明,卵母细胞通过调节乳酸对线粒体呼吸的贡献,在不同营养条件下维持呼吸速率稳态。
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控制理论分析动态代谢响应,阐明线粒体与细胞质的耦联及营养物质分配
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Xingbo Yang,
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Daniel J Needleman
doi:
https://doi.org/10.64898/2026.06.28.735091
Xingbo Yang
¹ 德累斯顿工业大学生命物理学
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xingbo.yang{at}tu-dresden.de
Daniel J Needleman
² 哈佛大学分子与细胞生物学系及约翰·A·保尔森工程与应用科学学院
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摘要
细胞会根据环境变化调整其内部回路。因此,让细胞暴露于变化的条件下,可以用来探测细胞内部回路的内在动态。代谢网络就是这类回路的一个例子,因为环境条件发生瞬时改变时,代谢通量也会随之动态调整。现有的大多数理论框架都聚焦于细胞代谢稳态,并未考虑代谢通量变化的动态过程。在本研究中,我们采用控制理论中的传递函数分析,研究小鼠卵母细胞在氧气耗竭与恢复这一动态扰动下,线粒体和细胞质中 NADH 氧化通量的变化。我们观察到一个…
复氧后,细胞质中的 NADH 氧化通量出现过冲,而线粒体中的 NADH 氧化通量则未出现这一现象。代谢扰动实验和传递函数分析表明,这种细胞质 NADH 过冲源于线粒体与细胞质 NADH 循环之间的耦联。过冲程度取决于相互竞争的时间尺度:乳酸和丙酮酸与培养液的交换速率,以及乳酸脱氢酶催化二者相互转化的速率。将控制理论应用于这些数据,可推断丙酮酸和乳酸的交换与转化速率,并据此预测乳酸对线粒体呼吸的贡献。本研究表明,卵母细胞通过调节乳酸对线粒体呼吸的贡献,在不同营养条件下维持呼吸速率的稳态。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
基金信息
德国研究联合会(Deutsche Forschungsgemeinschaft),https://ror.org/018mejw64,EXC-2068-390729961
美国国立卫生研究院(National Institutes of Health),https://ror.org/01cwqze88,R01HD092550-01
美国国家科学基金会(U.S. National Science Foundation),https://ror.org/021nxhr62,PFI-TT-1827309、PHY-2013874、MCB-2052305
版权
本预印本的版权归作者/资助方所有;其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。
本预印本依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议提供。
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发布于 2026 年 7 月 1 日。
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控制理论分析动态代谢响应,阐明线粒体—细胞质耦联与营养物质分配
Xingbo Yang,Daniel J. Needleman
bioRxiv
2026.06.28.735091;
doi:https://doi.org/10.64898/2026.06.28.735091
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控制理论分析动态代谢响应,阐明线粒体—细胞质耦联与营养物质分配
Xingbo Yang,Daniel J. Needleman
bioRxiv
2026.06.28.735091;
doi:https://doi.org/10.64898/2026.06.28.735091
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关键词:代谢通量动力学 · 控制理论 · 线粒体—细胞质耦联 · NADH氧化 · 卵母细胞呼吸
原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.28.735091v1?rss=1