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摘要
核糖体蛋白质含有柔性末端区域,这些区域在电子密度重构过程中会被平均化,因此不会出现在基于X射线晶体学或冷冻电子显微镜获得的实验模型中。这些柔性蛋白片段(FPF)共同构成核糖体表面一层不可见的包被,其存在长期以来一直未受到系统性关注。本研究分析了来自细菌、真核生物和线粒体的36种核糖体中的FPF。我们发现,线粒体核糖体含有数量最多、长度最长的FPF。结构预测证实,在所有类别的核糖体中,FPF均主要呈无序状态。将FPF的氨基酸组成与全蛋白质组背景频率进行比较后,我们发现其组成存在显著且具有结构域特异性的偏倚。精氨酸与赖氨酸含量的比例与各核糖体类别所接触膜的心磷脂含量相对应。线粒体核糖体FPF中精氨酸的富集,也可能反映了由线粒体RNA颗粒这一富含RNA的环境所施加的选择压力;线粒体RNA颗粒是组装线粒体核糖体的无膜凝聚体。FPF中芳香族残基普遍缺乏,这不支持其具有由蛋白质驱动的液-液相分离倾向。我们的研究结果表明,这层通过柔性连接于核糖体的包被是所有核糖体中高度发挥功能的内在组成部分。
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关键词:核糖体蛋白 · 柔性蛋白片段 · 蛋白质无序区域 · 线粒体核糖体 · 核糖体表面包被
原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.18.733196v1?rss=1
来源出处
核糖体表面覆盖着一层柔性蛋白质片段。
https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.18.733196v1?rss=1