肽图谱分析是表征生物治疗性蛋白质的关键工具，也是单克隆抗体药物研发不可或缺的环节。本文介绍一种新的直接进样技术，可简化肽图谱数据的采集与分析，使分析速度最高提升约100倍。该方法称为 RaPiD-mAb-MS，将高通量板式样品制备与直接进样质谱分析相结合。RaPiD-mAb-MS 可在约1.5至2小时内分析96份样品，常规序列覆盖率超过95%，并已成功应用于28种不同抗体和2,000余份样品。本文展示了 RaPiD-mAb-MS 如何在耗时大幅缩短的情况下检测并定量氧化、脱酰胺、异构化、糖基化和序列变异，且所得结果与传统 LC-MS 方法相当。此外，由于无需进行色谱分离，数据分析流程大为简化。RaPiD-mAb-MS 每天可采集约1,000份肽图谱，有望加速抗体类药物发现与开发的各个阶段，并为构建大规模数据集奠定基础，从而支持人工智能预测最优抗体变体及制剂。
J.J.C. 是 Thermo Fisher Scientific 和 Seer 的顾问。J.J.C. 和 L.M.S. 共同创立了 CeleramAb Inc.，以商业化推广该方法。
A.M.G.T. 和 M.P.G. 是 AbbVie Inc. 的员工。
J.A. 和 M.B. 是 Lilly and Company 的员工。
B.R.P.、G.L. 和 H.P.G. 是 Johnson & Johnson Innovative Medicine 的员工。
W.P. 和 W.S. 是 Genentech Inc. 的员工。
I.J.M.、C.W. 和 A.S.H. 是 CeleramAb 的顾问。
A.Z.S.、A.S.H.、C.W.、M.M.、K.L.M. 和 J.J.C. 是相关知识产权的发明人。
关于本研究。
其余作者声明不存在利益冲突。
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关键词：单克隆抗体 · 肽图谱分析 · 质谱分析 · 高通量分析 · 抗体药物开发
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.14.725248v1?rss=1