皮肤溃疡，例如非性传播疾病雅司病和性传播疾病梅毒病例中观察到的溃疡，传统上依据其解剖部位和可见外观进行诊断。然而，多方面证据表明，引发这些溃疡的病原体可能并不限于生殖器或非生殖器部位。我们通过对采自加纳的生殖器和非生殖器皮肤溃疡进行细菌群落分析，探讨了这一问题；分析采用16S rRNA基因扩增子测序。研究共采集156处经临床诊断的皮肤病灶拭子样本（非生殖器病灶110处，生殖器病灶46处），并对16S rRNA基因V1-V2区进行测序，以表征细菌群落。我们采用生物信息学和统计学方法，分析微生物多样性、群落组成、差异丰度，以及病灶多样性与常见皮肤细菌之间的关联。经质量过滤后，保留135份样本，共检出23个细菌门、143个科和406个属。α多样性分析显示，生殖器与非生殖器皮肤病灶的细菌丰富度和多样性相近。β多样性分析显示，两类病灶的群落组成存在差异，且组内离散度也存在显著差异。log2倍数变化分析表明，生殖器病灶中Gardnerella富集；而非生殖器病灶中Staphylococcus、Streptococcus、Corynebacterium、Bradyrhizobium和Pelomonas的丰度较高。包括Treponema、Haemophilus和Mycobacterium在内的临床重要菌属也被检出，即使在测序深度较低的样本中亦如此。统计建模显示，微生物多样性较高与常见皮肤分类群（尤其是Corynebacteriaceae、Micrococcaceae，……）的中等丰度相关。Cutibacterium 和葡萄球菌科的存在进一步证实，皮肤溃疡中存在多菌种群落。总体而言，生殖器与非生殖器皮损的微生物多样性相近，但群落组成有所不同。我们的研究结果支持这样一种观点：皮损是容纳多样细菌群落的生态位，而非始终由单一细菌分类群占据优势。这些发现为研究皮肤溃疡中可能存在的多菌种相互作用奠定了基础。
4 北卡罗来纳大学教堂山分校全球健康与传染病研究所，美国北卡罗来纳州教堂山；
在 Google Scholar 上查找该作者
在 PubMed 上查找该作者
在本站搜索该作者
Christopher M Hennelly
4 北卡罗来纳大学教堂山分校全球健康与传染病研究所，美国北卡罗来纳州教堂山；
在 Google Scholar 上查找该作者
在 PubMed 上查找该作者
在本站搜索该作者
Saki Raheem
5 威斯敏斯特大学生命科学学院，英国伦敦；
在 Google Scholar 上查找该作者
在 PubMed 上查找该作者
在本站搜索该作者
查看 Saki Raheem 的 ORCID 记录
Natasha Arora
6 苏黎世大学苏黎世法医学研究所法医遗传学系，瑞士苏黎世；
在 Google Scholar 上查找该作者
在 PubMed 上查找该作者
在本站搜索该作者
Jonathan B Parr
4 北卡罗来纳大学教堂山分校全球健康与传染病研究所，美国北卡罗来纳州教堂山；
在 Google Scholar 上查找该作者
在 PubMed 上查找该作者
在本站搜索该作者
Pascale Gerbault
7 日内瓦大学遗传学与进化系人类学、遗传学与群体实验室，瑞士
在 Google Scholar 上查找该作者
在 PubMed 上查找该作者
在本站搜索该作者
查看 Pascale Gerbault 的 ORCID 记录
通讯作者：
pascale.gerbault{at}unige.ch
摘要
信息/历史
指标
补充材料
PDF 预览
摘要
皮肤溃疡，例如非性传播疾病雅司病和性传播疾病梅毒病例中出现的皮肤溃疡，传统上依据其解剖部位和可见外观进行诊断。然而，各种证据表明
导致这些溃疡的病原体可能并不限于生殖器或非生殖器部位。为探究这一问题，我们采用 16S rRNA 基因扩增子测序，对采集自加纳的生殖器及非生殖器皮肤溃疡中的细菌群落进行分析。
研究人员从 156 处经临床诊断的皮肤病灶采集拭子样本，其中非生殖器病灶 110 处，生殖器病灶 46 处。对 16S rRNA 基因 V1–V2 区进行测序，以表征细菌群落。采用生物信息学和统计学方法分析微生物多样性、群落组成、差异丰度，以及病灶多样性与常见皮肤细菌之间的关联。
经质量过滤后，保留 135 个样本，共检出 23 个细菌门、143 个科和 406 个属。α 多样性分析显示，生殖器与非生殖器皮肤病灶的细菌丰富度和多样性相近。β 多样性分析显示，两类病灶之间存在差异，且组内离散度也存在显著差异。log₂ 倍数变化分析表明，生殖器病灶中 Gardnerella 富集；非生殖器病灶中 Staphylococcus、Streptococcus、Corynebacterium、Bradyrhizobium 和 Pelomonas 的丰度较高。即使在测序深度较低的样本中，也检测到了 Treponema、Haemophilus 和 Mycobacterium 等具有重要临床意义的菌属。统计建模显示，较高的微生物多样性与常见皮肤分类单元的中等丰度相关，尤其是 Corynebacteriaceae、Micrococcaceae、Cutibacterium 和 Staphylococcaceae，表明皮肤溃疡中存在多微生物群落。
总体而言，生殖器与非生殖器皮肤病灶的微生物多样性相近，但群落组成存在差异。我们的…
研究结果支持这样一种观点：皮肤病变是包含多种细菌群落的生态位，而非始终由单一细菌类群占据主导地位。这些结果为探究皮肤溃疡中可能存在的多微生物相互作用提供了依据。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
资助信息声明
威斯敏斯特大学全球研究挑战基金，SRO03150
比尔及梅琳达·盖茨基金会，INV-036560
英国皇家学会2021年第三轮国际交流项目，IES\R3\213065
版权
本预印本的版权持有人为作者／资助方，并已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。
本内容依据 CC-BY 4.0 国际许可协议公开。
返回顶部
上一篇
下一篇
发布于2026年10月08日。
下载 PDF
补充材料
电子邮件
感谢您有意帮助传播 bioRxiv 的内容。
注意：此处要求提供您的电子邮件地址，仅用于确认您是本文的发送者。
您的电子邮件地址
*
您的姓名
*
收件人
*
请在不同的行中输入多个地址，或用逗号分隔。
您将要发送以下内容：
加纳生殖器及非生殖器皮肤病变的微生物群落特征
邮件主题
（您的姓名）向您转发了 bioRxiv 网站上的一个页面
邮件正文
（您的姓名）认为您可能会对 bioRxiv 网站上的这个页面感兴趣。
您的个人留言
验证码
此问题用于确认您是真人访问者，并防止自动垃圾信息提交。
分享
加纳生殖器及非生殖器皮肤病变的微生物群落特征
Yaw Agyekum Boaitey，
Alex OWUSU-OFORI，
Philipp P Bosshard，
Farhang AGHAKHANIAN，
Christopher M Hennelly，
Saki Raheem，
Natasha Arora，
Jonathan B Parr，
Pascale Gerbault
bioRxiv
2026.10.06.757009；
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.10.06.757009
分享本文：
复制
引文工具
加纳生殖器及非生殖器皮肤病灶的微生物群落谱
Yaw Agyekum Boaitey、Alex OWUSU-OFORI、Philipp P Bosshard、Farhang AGHAKHANIAN、Christopher M Hennelly、Saki Raheem、Natasha Arora、Jonathan B Parr、Pascale Gerbault
bioRxiv
2026.10.06.757009；
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.10.06.757009
引文管理器格式
BibTeX
Bookends
EasyBib
EndNote（标记格式）
EndNote 8（xml）
Medlars
Mendeley
Papers
RefWorks Tagged
Ref Manager
RIS
Zotero
推文组件
Facebook 点赞
Google Plus +1
学科领域
所有文章
动物行为与认知（8101）
生物化学（18916）
生物工程（15076）
生物信息学（44909）
生物物理学（22804）
癌症生物学（19935）
细胞生物学（27143）
临床试验（138）
发育生物学（14065）
生态学（21239）
流行病学（2067）
进化生物学（25637）
遗传学（16270）
基因组学（23673）
免疫学（18872）
微生物学（42902）
分子生物学（18221）
神经科学（94380）
古生物学（708）
病理学（3011）
药理学与毒理学（5143）
生理学（8205）
植物生物学（16151）
科学传播与教育（2106）
合成生物学（4604）
系统生物学（10325）
动物学（2405）
关键词：皮肤微生物组 · 细菌群落测序 · 16S rRNA扩增子测序 · 群落多样性 · 皮肤溃疡
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.06.757009v1?rss=1