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我们采用脑细胞外囊泡（extracellular vesicle，EV）蛋白质组学，鉴定急性神经炎症及基于EV的微小RNA干预所引起的蛋白质应答。大鼠分别接受溶媒、脑室内注射脂多糖（lipopolysaccharide，LPS），或在注射LPS后静脉给予含抗炎微小RNA（microRNA，miRNA）的EV制剂。在给予LPS或溶媒24 h后采集脑组织，每组取3份独立处理的动物来源EV富集制备物，进行非标记定量蛋白质组学分析。在全部9份样本中，953个蛋白质组具有完整的归一化丰度测量值。与溶媒对照组相比，在名义P < 0.05且log2倍数变化绝对值 ≥ log2(1.5)的标准下，LPS暴露与227项探索性蛋白质变化相关，其中95项升高，132项降低。升高的蛋白质富集于翻译相关注释类别，而降低的蛋白质富集于质膜相关注释类别。经Benjamini–Hochberg校正后，这些LPS相关变化在错误发现率（false discovery rate，FDR）阈值q < 0.05下均不再具有统计学显著性。治疗后，227个候选蛋白质中有119个在log2尺度上的丰度更接近对照水平；另有23个候选蛋白质在治疗组与LPS组之间的比较中也表现出名义显著差异。经FDR校正后，Lamb2和Ptgfrn是治疗组与仅接受LPS的动物之间存在显著差异的两个蛋白质，因此被确定为后续验证的优先对象。然而，治疗组动物与溶媒对照组之间仍有174个蛋白质存在显著差异，且对所测蛋白质的整体分析未显示其总体向对照值偏移。因此，该干预与特定的蛋白质应答相关，但治疗组动物与对照组之间仍存在较大差异。本研究鉴定了可用于探究脑源性EV富集制备物治疗反应的候选标志物，并证明了在考察更广泛蛋白质组变化的同时分析单个蛋白质的价值。仍需开展独立验证，以确定这些标志物的功能相关性，并区分miRNA特异性效应与给药所用EV载体的作用。
脂多糖刺激及miRNA相关囊泡给药后脑细胞外囊泡富集制备物的探索性蛋白质组学研究 | bioRxiv
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脂多糖刺激及miRNA相关囊泡给药后脑细胞外囊泡富集制备物的探索性蛋白质组学研究
Kent
Brown
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Wang
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Shan
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Lanrong
Bi
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https://doi.org/10.64898/2026.10.06.757102
Kent Brown
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我们利用脑细胞外囊泡（EV）蛋白质组学，鉴定对急性神经炎症及基于EV的微小RNA干预产生响应的蛋白质。大鼠分别接受溶媒、脑室内注射脂多糖（LPS），或在给予LPS后静脉注射含抗炎微小RNA（miRNA）的EV制剂。在给予LPS或溶媒后24小时采集脑组织，每组取3份独立处理的动物来源EV富集制备物，进行非标记定量蛋白质组学分析。在全部9份样本中，953个蛋白质组具有完整的归一化丰度数据
测量。与溶媒对照相比，LPS暴露与227种探索性蛋白质变化相关，其中95种蛋白质丰度升高，132种降低，筛选标准为名义P < 0.05且log2倍数变化的绝对值 ≥ log2(1.5)。丰度升高的蛋白质富集于翻译相关功能注释，而丰度降低的蛋白质富集于质膜相关注释。在以q < 0.05为假发现率（FDR）阈值进行Benjamini–Hochberg校正后，这些与LPS相关的变化均不再具有统计学显著性。治疗后，227种候选蛋白质中有119种在log2尺度上的丰度更接近对照水平；其中23种候选蛋白质在治疗组与LPS组之间也表现出名义上的显著差异。经FDR校正后，Lamb2和Ptgfrn是治疗动物与仅接受LPS的动物之间存在显著差异的两种蛋白质，因此被确定为后续验证的优先对象。然而，治疗动物与溶媒对照之间仍有174种蛋白质存在显著差异，且对所测蛋白质的综合分析未显示出整体向对照值回归的趋势。因此，该干预与特定蛋白质反应相关，但治疗动物与对照之间仍存在显著差异。本研究确定了用于探究脑源性细胞外囊泡（EV）富集制备物中治疗反应的候选标志物，并表明在考察更广泛的蛋白质组变化的同时分析单个蛋白质具有重要价值。仍需开展独立验证，以确定其功能相关性，并区分miRNA特异性效应与所施用EV载体的作用。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
已声明的资助方信息
美国国立卫生研究院（NIH）
，R15 EB035866
，R01HL163159
美国心脏协会，
，1807047
版权
版权
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发布于2026年10月13日。
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2026.10.06.757102;
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LPS 刺激及 miRNA 相关囊泡给药后脑细胞外囊泡富集制备物的探索性蛋白质组学研究
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关键词：脑细胞外囊泡 · 神经炎症 · 脂多糖刺激 · miRNA递送 · 蛋白质组学 · 生物标志物
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.06.757102v1?rss=1