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内容形式:摘要译文
异种移植序列分选工具可按物种对DNA测序读段进行分类。我们改进了计算方法及工具Xengsort,以实现对患者来源异种移植模型的高效表观遗传谱分析;该工具现已支持经胞嘧啶转换的全基因组或简化代表性测序数据。将Xengsort与多种成熟方法(ICRG、bamcmp、XenofilteR)进行基准比较后发现,各工具均表现出较高的准确性,而Xengsort凭借其无需序列比对的设计,在计算效率上优于其他工具。
关键词:DNA甲基化 · 异种移植 · 测序读段分选 · 胞嘧啶转换测序 · 无比对算法 · 表观遗传分析
原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.06.756952v1?rss=1
来源出处
用于DNA甲基化分析的高性能异种移植测序读段分选
https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.06.756952v1?rss=1