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海上工业在评估水体环境影响并满足相关监管要求时，仍主要依赖传统方法。采用环境 DNA（eDNA）工作流程具有诸多优势，但若要将其常规应用于海上监测项目，采样和样本保存等前期环节仍需标准化并加以简化。本研究评估了几种滤膜类型对 eDNA 采样的影响，包括 Durapore 圆片滤膜、Sterivex 胶囊式滤膜和 Wattera 大容量胶囊式滤膜（孔径均为 0.22 μm），这些滤膜可处理不同体积的水样。我们还评估了在无法立即过滤并冷藏的情况下，使用不同保存液保存未经滤过水样 25 天的效果，以判断其是否为可行方案。所用保存液包括苯扎氯铵（BAC）、Longmire 溶液（LONGI）和不含 SDS 的改良 Longmire 溶液（LNoSDS）。为评估不同滤膜和保存方式对后续 eDNA 分析的影响，我们对选定的目标 DNA 进行了定量数字 PCR，并通过宏条形码测序对海洋原核生物和真核生物群落进行定性评估。总体而言，与水样保存方式相比，滤膜选择对 eDNA 定量和定性信息的影响相对较小。Sterivex 和 Durapore 是生物多样性评估中较好的滤膜选择。Wattera 滤膜可处理更大体积的水样，并提高后生动物 DNA 的定量能力，但其操作和处理难度较大。在水样保存方面，LNoSDS 是最佳选择。LONGI 和 BAC 中的化学试剂可能为某些耐受性细菌菌株提供有利的生长基质，从而改变微生物群落组成，并影响保存后 eDNA 整体的定性评估。然而，对于目标后生动物环境 DNA（eDNA），化学保存显示出明显优势。本研究强调了在离岸水柱监测中实施 eDNA 采样及无需冷藏的简易保存流程时需要考虑的关键因素和可行方案。
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关键词：环境DNA · 水柱监测 · 滤膜评估 · 样品保存 · 宏条形码测序
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.18.733101v1?rss=1