转录因子（TF）被募集至非其认知的 DNA 序列这一现象已被广泛观察到，但其背后的机制仍未得到充分阐明。在此，我们发现，在核小体内，Sox2 能够结合 Oct4 基序，与 Oct4 的 POU 特异性结构域相互作用，并置换 Oct4 同源异型结构域。我们还观察到，Sox2 可结合多个近经典和非经典 DNA 位点；第二个 Sox2 分子或邻近的核小体结合型 Oct4 均可促进这些相互作用。TF-TF 相互作用能够跨越 DNA 螺旋圈，将在线性 DNA 上相距较远、但在核小体上空间位置相近的结合位点连接起来。我们进一步发现，Sox2 可通过环区和/或内在无序片段跨越核小体 DNA 螺旋圈进行结合，从而提供另一种染色质结合模式。综上，我们的结构与生化数据揭示了 TF-TF 相互作用如何改变转录因子在核小体上的 DNA 识别，使其能够结合非其认知的序列，并拓展先锋因子在染色质上的相互作用谱。
转录因子（TF）被募集至非对应 DNA 序列的现象十分普遍，但其潜在机制仍未得到充分理解。在此，我们发现，在核小体内，Sox2 可以结合 Oct4 基序，与 Oct4 的 POU 特异性结构域相互作用，并置换 Oct4 同源异型结构域。我们还观察到，Sox2 可结合多个近典型和非典型 DNA 位点；第二个 Sox2 分子或附近与核小体结合的 Oct4 可促进这些相互作用。TF-TF 相互作用能够跨越 DNA 螺旋圈，将在线性 DNA 上相距较远、但在核小体上空间位置相近的结合位点连接起来。我们进一步发现，Sox2 可通过环区和/或内在无序片段跨越核小体 DNA 螺旋圈相互作用，从而提供另一种染色质结合方式。综合来看，我们的结构与生化数据揭示了 TF-TF 相互作用如何改变转录因子在核小体上的 DNA 识别，使其能够结合非对应序列，并拓展先锋因子在染色质上的相互作用模式。
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关键词：转录因子 · Sox2-Oct4相互作用 · 核小体 · 非特异性DNA结合 · 先锋因子 · 染色质结合
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.08.757710v1?rss=1