热带流域土壤耐药组受细菌群落与土壤性质相互作用的间接调控

由 root 提交于 周四, 10/15/2026 - 04:57
摘要

土壤被认为是抗生素抗性基因(ARGs)的储库,这些基因可能转移至临床病原体,进而产生抗微生物药物耐药性(AMR),威胁人类健康。尽管大规模AMR调查已描绘出多样化生物群系如何塑造土壤耐药组,但特定土壤性质的影响仍鲜为人知。本研究结合宏基因组学、16S rRNA扩增子测序与基于分离株的方法,考察了夏威夷瓦胡岛怀梅阿山谷从海滩到山顶这一热带流域中土壤AMR的驱动因素。我们利用耐药性功能分类和分类学分类,揭示土壤性质如何与细菌类群相互作用并塑造耐药组。宏基因组耐药组与分离株耐药组表现出显著一致性,其中包括从山脊到海滩AMR总体递增的梯度。耐药组的功能组成与细菌群落整体结构显著相关。耐药性与土壤性质之间的关系,主要由各类耐药性的分类学组成所决定。与放线菌相关的利福平和万古霉素抗性基因与土壤物理性质呈负相关,而γ-变形菌门来源的抗性基因及分离株则与酶活性指标呈正相关。这些发现表明,土壤性质通过对微生物宿主进行分类学筛选,间接塑造耐药组;同时也对AMR与系统发育亲缘关系相互独立这一观点提出了质疑。

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关键词:土壤耐药组 · 抗生素抗性基因 · 细菌群落 · 土壤性质 · 宏基因组学

原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.18.733189v1?rss=1