细胞内与衣壳化病毒 RNA 的比较揭示了呼肠孤病毒重组的选择性约束

内容形式：摘要译文

重组能够在RNA病毒之间产生遗传多样性；然而，对于分节段双链RNA病毒而言，调控重组的机制仍知之甚少。呼肠孤病毒基因组由十个双链RNA节段组成。既往分析表明，呼肠孤病毒RNA的重组率较低，并据此提出了重组发生于负链合成过程中的机制。这些分析主要关注从纯化病毒颗粒中提取的基因组双链RNA内检测到的重组事件。本研究通过检测细胞内总物质，进一步探究了所观察到的重组事件的起源。细胞内总物质不仅包括病毒基因组物质，还包括复制中间体、mRNA以及可能不具备被包装进病毒颗粒条件的重组产物。细胞内病毒RNA几乎全部为正链RNA，其重组频率显著高于病毒颗粒相关的双链RNA。在不同感染样本中，同一类型样本（细胞内样本或病毒体包裹样本）所鉴定的连接点，其多样性和频率比同一感染中不同类型样本之间更为相似。尽管潜在的重组位点广泛分布于整个基因组中，但与细胞内病毒RNA相比，包装病毒RNA中的连接点仅利用了其中较为有限的一组位点。综上，这些观察结果表明，呼肠孤病毒感染期间发生的重组可能比此前认识的更为频繁，其中许多事件很可能发生于正链合成过程中。然而，在病毒转录过程中产生的重组产物可能会被选择性地整合进入病毒颗粒。

关键词：呼肠孤病毒 · RNA病毒重组 · 双链RNA病毒 · 病毒基因组包装 · 正链RNA合成

原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.10.757791v1?rss=1