Syntrophus aciditrophicus来源的AMP生成型乙酰辅酶A合成酶中催化方向性的结构决定因素

由 root 提交于 周四, 10/15/2026 - 07:12

内容形式:摘要译文

乙酰辅酶A(CoA)是连接所有生命域中碳代谢与能量代谢的核心代谢中间体。乙酸与乙酰辅酶A之间的转化由三种酶促途径介导:乙酸激酶/磷酸转乙酰酶、ADP生成型乙酰辅酶A合成酶,以及AMP生成型乙酰辅酶A合成酶(Acs)。Acs酶在多种生物中发挥关键的生理作用,通常通过催化可逆的两步反应,由乙酸和ATP生成乙酰辅酶A和AMP。Syntrophus aciditrophicus SB菌株(Sa)分离自俄克拉荷马州诺曼市的污水再生设施;该菌依赖一种AMP生成型乙酰辅酶A合成酶(SaAcs1),其反应倾向于由乙酰辅酶A和AMP合成乙酸和ATP,这与此前表征的所有Acs酶均不同。这种反应偏好的起源,以及硫酯形成步骤和催化方向性的结构决定因素,仍未得到充分认识。本文报道了SaAcs1全长蛋白在腺苷酸化构象下、活性位点结合乙酰基-AMP的2.2 Å晶体结构。与研究充分的肠沙门氏菌(Salmonella enterica)Acs(SeAcs)和新型隐球菌(Cryptococcus neoformans)Acs(CnAcs)进行结构比较后发现,SaAcs1中的CoA结合环发生了位移。酶学测定证实,SaAcs1优先催化生成ATP的反应。定点诱变表明,将CoA结合环起始处的两个残基G196和T197回复为共有序列,可使该环重新定位,并使催化偏好转向AMP生成方向。综上,这些结果确立了CoA结合环以及G196和T197是决定SaAcs1反应方向偏好的主要结构因素。

关键词:AMP生成型乙酰辅酶A合成酶 · 催化方向性 · 蛋白质晶体结构 · 乙酰基-AMP中间体 · 酶学机制

原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.06.736832v1?rss=1