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对经天然加工并与主要组织相容性复合体I类（MHC-I）分子结合的肽进行表征，对于明确等位基因特异性肽结合特征以及理解MHC-I多态性的功能影响至关重要。然而，目前针对犬白细胞抗原（DLA）I类（DLA-I）分子的免疫肽组分析仍然有限，且尚缺乏常见DLA-88等位基因的全面单等位基因配体数据集。本研究建立了分别表达单个功能性DLA-88等位基因的犬黑色素瘤来源细胞群体，并构建了常见DLA-88等位基因的单等位基因免疫肽组图谱。通过液相色谱-串联质谱分析，我们在10种DLA-88等位基因中共鉴定出32,702条长度为7至15个氨基酸的天然加工肽，显著拓展了现有DLA-88免疫肽组的覆盖范围。这10种等位基因呈现出典型的肽长度分布及等位基因特异性结合基序，后者反映了依据人MHC-I肽接触残基所定义的结合槽伪序列的差异。DLA-88等位基因之间的配体共享与结合位点距离相关。纳入本研究中经全面表征的DLA-88配体数据集后，在已发表的犬DLA-I等位基因中，具有经配体表征且预测肽结合特征相似的参考等位基因者，其数量增加了四倍以上。我们还发现，抗原加工特征与人类中已报道的特征高度保守。作为概念验证性应用，我们通过评估来源蛋白在正常组织中的表达谱，从免疫肽组分析所鉴定的DLA-88结合肽中筛选出54条，作为犬癌症免疫治疗的候选肽。该DLA-88免疫肽组图谱为深入理解抗原呈递的等位基因依赖性差异，并为开发准确的DLA-88结合肽预测工具和支持犬类基于肽的免疫学研究提供了宝贵资源。
1
冈山理科大学兽医学部，日本爱媛县今治市憩之丘1-3，邮编794-8555；
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Kohei Murakami
1
冈山理科大学兽医学部，日本爱媛县今治市憩之丘1-3，邮编794-8555；
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Hiroaki Hemmi
2
和歌山县立医科大学先进医学研究所免疫学系，日本和歌山县和歌山市纪三井寺811-1，邮编641-8509
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摘要
对经天然加工并与主要组织相容性复合体I类（MHC-I）分子结合的肽进行表征，对于确定等位基因特异性的肽结合特征以及理解MHC-I多态性的功能影响至关重要。然而，针对犬白细胞抗原（DLA）I类（DLA-I）分子的免疫肽组分析仍较为有限，且目前仍缺乏常见DLA-88等位基因的完整单等位基因配体数据集。本研究建立了分别表达单个功能性DLA-88等位基因的犬黑色素瘤来源细胞群，并构建了常见DLA-88等位基因的单等位基因免疫肽组图谱。通过液相色谱-串联质谱分析，我们在10个DLA-88等位基因中共鉴定出32,702条经天然加工、长度为7至15个氨基酸的肽，显著拓展了现有的DLA-88免疫肽组图谱。这10个等位基因呈现出典型的肽长度分布和等位基因特异性结合基序，这些基序
反映了基于人类 MHC-I 肽接触残基所定义的结合槽伪序列的变异。DLA-88 等位基因之间的配体共享与结合位点距离相关。纳入本研究中经过全面表征的 DLA-88 配体数据集后，在已发表的犬 DLA-I 等位基因中，预测具有与已完成配体表征的参考等位基因相似肽结合特征的等位基因数量增加至原来的四倍以上。我们还发现，抗原加工特征与人类中已报道的特征高度保守。作为概念验证性应用，我们通过评估来源蛋白在正常组织中的表达谱，从免疫肽组分析鉴定出的 DLA-88 结合肽中筛选出 54 条，作为犬癌症免疫治疗的候选肽。该 DLA-88 免疫肽组图谱揭示了抗原呈递中依赖于等位基因的差异，并为开发准确的 DLA-88 结合肽预测工具及支持犬的肽相关免疫学研究提供了宝贵资源。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
已声明的资助信息
日本学术振兴会（JSPS）科研费资助项目（KAKENHI），青年科学家研究资助
，JP21K14979
，JP24K18031
版权
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保留所有权利。未经许可，不得以任何形式再利用。
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发布于 2026 年 10 月 12 日。
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10种常见犬DLA-88等位基因的单等位基因免疫肽组图谱
Jiro
Miyamae
，
Kohei
Murakami
，
Hiroaki
Hemmi
bioRxiv
2026.10.06.756904；
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.10.06.756904
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10种常见犬DLA-88等位基因的单等位基因免疫肽组图谱
Jiro
Miyamae
，
Kohei
Murakami
，
Hiroaki
Hemmi
bioRxiv
2026.10.06.756904；
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.10.06.756904
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关键词：犬白细胞抗原 · DLA-88等位基因 · 免疫肽组学 · 抗原呈递 · 肽结合基序 · 犬癌症免疫治疗
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.06.756904v1?rss=1