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内容形式:摘要译文
在急性病毒感染中,规模较小的初始种群会迅速扩增数个数量级,随后缩减。随着感染扩散至宿主体内新的解剖部位,这种大规模的种群增长也伴随着空间扩张。进化理论预测,与无空间结构的种群相比,空间扩张中的种群会经历更为剧烈的遗传多样性随机丧失。为在病毒动力学背景下检验这一预测,我们评估了空间扩张对病毒种群遗传结构的影响,并考察了病毒扩散的调节因素如何影响这一结构。为此,我们建立了一种在细胞培养体系中实现甲型流感病毒空间扩张的方法,并将其应用于携带多样化遗传条形码的病毒种群。在这一简化的细胞空间环境中,我们发现,空间扩张会形成由不同病毒亚种群构成的斑块状格局。随后,我们评估了细胞外黏度和病毒附着蛋白中的一种常见多态性这两种病毒扩散调节因素对种群结构的影响。物理限制和病毒表型均改变了扩张过程中遗传瓶颈效应的程度及空间异质性的大小,表明调节扩散的环境特征和病毒性状也会调节病毒种群的组成、多样性及进化。
关键词:病毒种群遗传结构 · 空间扩张 · 遗传瓶颈 · 甲型流感病毒 · 遗传多样性
原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.12.758528v1?rss=1
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