以基因为中心的拷贝数变异分析揭示抑癌基因对癌症风险的调节作用及其与常见疾病的新关联

内容形式：摘要译文

拷贝数变异（CNVs）是人类基因组变异的重要来源。它们可以跨越包含完整基因及其侧翼区域的大型基因组区段，从而有可能改变个体中功能性基因拷贝的数量。通常，CNV会被单独分析，或在不考虑其所跨越基因的情况下按区域进行整合。在本研究中，我们采用以基因为中心的方法，将完整基因拷贝数的变化与表型联系起来。首先，我们利用GTEx数据考察了跨越完整基因的CNV与基因表达之间的关系，发现预测的基因表达效应通常确实能够实现。应用这一方法，我们鉴定出34个与癌症发生率相关的基因缺失，其中包括若干新的候选关联。最值得注意的是，我们发现13q14区域的基因缺失与癌症风险升高相关，这是将已知的体细胞关联扩展至生殖系的一项新发现；采用基于区域的方法则无法发现这一关联。正如假设所预期的那样，统计分析发现，肿瘤抑制基因的完整基因丧失与总体癌症风险之间存在关联。此外，我们还发现，完整基因丧失的总数与癌症风险升高具有强关联，即使在计数时排除已知的癌症相关基因，这一关联仍然存在。最后，我们将这些方法拓展至非癌症表型，发现其与包括哮喘和心脏病发作在内的常见疾病存在显著关联。

关键词：拷贝数变异 · 基因中心分析 · 抑癌基因 · 癌症风险 · 生殖系遗传变异 · 常见疾病关联

原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.06.757170v1?rss=1