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CREB调控的转录共激活因子1(CREB-regulated transcription coactivator 1,CRTC1)参与调控神经元发育、可塑性及依赖活动的转录过程,但其在髓母细胞瘤(medulloblastoma,MB)中的作用尚未得到充分阐明。我们研究了人类小脑发育过程中及多种儿童脑肿瘤中CRTC1基因的表达,并利用公开转录组数据集考察了其在MB中的分子及临床相关性。CRTC1在发育中的小脑内广泛表达,但在颗粒细胞谱系内部呈现细胞状态特异性的差异。在儿童脑肿瘤中,MB的CRTC1表达中位数最高;不同MB分子分组及亚型之间的表达水平存在显著差异,其中第4组MB的表达水平最高。高CRTC1表达仅在第3组β型MB中与更长的总生存期相关,并且在针对12种分子亚型进行校正后,该相关性仍具有统计学意义。在第3组β型肿瘤中,CRTC1表达与线粒体及生物能量学过程的富集程度呈负相关,包括氧化磷酸化、线粒体组织及线粒体翻译;同时,CRTC1高表达与低表达肿瘤呈现不同的转录谱。CRTC1还与若干与细胞类型相关的转录特征存在关联,这些特征与肿瘤微环境有关。这些发现表明,CRTC1可作为第3组β型MB中具有生物学和临床意义的转录异质性标志物,并支持进一步研究其功能及预后意义。
CREB调节的转录共激活因子1(CRTC1)参与调控神经元发育、可塑性和活动依赖性转录,但其在髓母细胞瘤(MB)中的作用仍知之甚少。我们研究了CRTC1基因在人类小脑发育过程中的表达情况及其在儿童脑肿瘤中的表达特征,并利用公开转录组数据集考察了其在MB中的分子和临床关联。CRTC1在发育中的小脑内广泛表达,但在颗粒细胞谱系内部呈现细胞状态特异性的差异。在儿童脑肿瘤中,MB的CRTC1表达中位数最高;不同MB分子群及亚型之间的CRTC1表达存在显著差异,其中第4组MB的表达水平最高。高CRTC1表达仅在第3组β型MB中与更长的总生存期相关,并且在对12种分子亚型进行校正后,该关联仍具有统计学意义。在第3组β型肿瘤中,CRTC1表达与线粒体和生物能量过程的富集呈负相关,包括氧化磷酸化、线粒体组织以及线粒体翻译;此外,CRTC1高表达肿瘤与CRTC1低表达肿瘤呈现不同的转录特征。CRTC1还与若干特定的细胞类型相关转录特征存在关联,这些特征与肿瘤微环境有关。这些发现表明,CRTC1可作为第3组β型MB中具有生物学和临床意义的转录异质性标志物,并支持进一步研究其功能及预后意义。
作者声明不存在利益冲突。
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关键词:CRTC1基因 · 髓母细胞瘤 · 第3组β型 · 线粒体生物能量学 · 肿瘤微环境 · 预后标志物
原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.06.757146v1?rss=1