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猪δ冠状病毒（porcine deltacoronavirus，PDCoV）是一种在全球范围内传播的猪冠状病毒，可在新生仔猪中引发严重的肠道疾病并导致死亡。其广泛的宿主范围及人畜共患病潜力引发了人们对其持续溢出传播至人群的担忧。然而，目前对于决定PDCoV感染的宿主因素仍知之甚少。鉴定参与病毒感染的宿主因子，有望发现可用于抗病毒药物开发的新型治疗靶点，或用于基因编辑以培育抗病猪的靶点。在本研究中，我们开展了全基因组CRISPR敲除（GeCKO）筛选，以鉴定促进PDCoV感染猪睾丸（ST）细胞的宿主因子。靶向ANPEP基因的小向导RNA（sgRNA）在PDCoV耐受细胞中富集；ANPEP基因编码PDCoV的主要受体——猪氨基肽酶N，从而证明了该筛选的有效性。此外，我们鉴定出跨膜蛋白30A（TMEM30A）是PDCoV感染所依赖的宿主因子。TMEM30A是P4-ATP酶翻转酶复合物的辅助β亚基。同时，我们还发现了若干潜在的PDCoV诱导细胞死亡调控因子，包括DET1、IFNAR1、RFWD2、STAT1和TP53。进一步研究表明，在TMEM30A敲除的ST细胞中，PDCoV的吸附及其进入细胞的过程均受到显著抑制，提示TMEM30A在PDCoV生命周期的早期阶段发挥重要作用。鉴于TMEM30A同样参与SARS-CoV-2的复制，未来有必要进一步研究其在冠状病毒感染中的作用机制。
全基因组 CRISPR 敲除筛选鉴定猪丁型冠状病毒感染的宿主依赖因子及潜在病毒诱导细胞死亡调控因子 | bioRxiv
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全基因组 CRISPR 敲除筛选鉴定猪丁型冠状病毒感染的宿主依赖因子及潜在病毒诱导细胞死亡调控因子
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Scott P Kenney
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.10.06.755730
Thamonpan Laocharoensuk
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Patricia A Boley
2
美国农业部国家生物与农业防御设施，堪萨斯州曼哈顿；
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Rosemary Blake
3
英国爱丁堡大学皇家（迪克）兽医学院及英国爱丁堡大学罗斯林研究所；
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Linda J Saif
4
美国俄亥俄州哥伦布市俄亥俄州立大学兽医学院兽医预防医学系，以及美国俄亥俄州伍斯特市俄亥俄州立大学食品、农业与环境科学学院动物科学系；
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scottpkenney{at}gmail.com
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猪丁型冠状病毒（porcine deltacoronavirus，PDCoV）是一种在全球范围内传播的猪冠状病毒，可导致新生仔猪严重的肠道疾病和死亡。其广泛的宿主范围及人畜共患潜力引发了人们对其持续溢出传播至人群的担忧。然而，目前对于调控 PDCoV 感染的宿主因子仍知之甚少。鉴定参与病毒感染的宿主因子，有望发现用于抗病毒药物开发的新型治疗靶点，或用于基因编辑以培育抗病猪的靶点。在本研究中，我们开展了全基因组 CRISPR 敲除（GeCKO）筛选，以鉴定促进 PDCoV 在猪睾丸（ST）细胞中感染的宿主因子。靶向 ANPEP 基因的小向导 RNA（sgRNA）在 PDCoV 抗性细胞中富集；该基因编码 PDCoV 的主要受体——猪氨基肽酶 N，证明了该筛选的有效性。此外，我们鉴定出跨膜蛋白 30A（TMEM30A）是 PDCoV 感染所依赖的宿主因子。TMEM30A 是 P4-ATPase 翻转酶复合物的辅助性 β 亚基。与此同时，我们还发现了若干潜在的 PDCoV 诱导细胞死亡调控因子，包括 DET1、IFNAR1、RFWD2、STAT1 和 TP53。进一步研究表明，在 TMEM30A 敲除的 ST 细胞中，PDCoV 的吸附和内化均受到显著抑制，提示 TMEM30A 在 PDCoV 生命周期的早期阶段发挥重要作用。鉴于 TMEM30A 也参与 SARS-CoV-2 的复制，未来有必要进一步研究其在冠状病毒感染背景下的作用机制。
利益冲突声明
作者声明不存在任何利益冲突。
已声明的资助信息
美国农业部国家食品与农业研究所，2020-67015-31618
生物技术与生物科学研究理事会，BBS/E/RL/230002A
Anandamahidol 基金会，https://ror.org/010tbvz48
版权
本预印本的版权所有者为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。
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发表于 2026 年 10 月 7 日。
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Thamonpan Laocharoensuk，
Patricia A Boley，
Rosemary Blake，
Vayalena Drampa，
Nicholas Parkinson，
Finn Grey，
Linda J Saif，
Qiuhong Wang，
Scott P Kenney
bioRxiv
2026.10.06.755730；
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.10.06.755730
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2026.10.06.755730；
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https://doi.org/10.64898/2026.10.06.755730
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关键词：全基因组CRISPR筛选 · 猪丁型冠状病毒 · 宿主依赖因子 · TMEM30A · 病毒诱导细胞死亡
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.06.755730v1?rss=1