统一框架揭示进化尺度与丰度加权如何塑造系统发育群落结构

内容形式：摘要译文

用于推断生物群落组装过程的系统发育群落结构指标被广泛采用，但现有指标仅能捕捉固定的系统发育尺度，并且在调控稀有类群和优势类群如何影响生态模式方面能力有限。在此，我们提出 q 加权插值平均系统发育距离（q-weighted interpolated mean phylogenetic distance，qiMPD），该框架能够在较宽泛的进化分化程度与最近分类单元距离之间进行连续插值，同时纳入可调节的丰度加权。将其应用于3661个污水微生物组后发现，丰度加权对大尺度系统发育离散度的影响较小，但会显著改变局部系统发育结构。零模型分析表明，群落内部的系统发育过度离散与聚集信号，以及群落之间的系统发育分化与趋同信号，会在系统发育局部性和丰度加权的不同组合下呈现。因此，qiMPD框架能够在系统发育尺度和丰度两个维度上解析群落组装过程。该框架已在Python软件包qdiv 4.2.0版中实现。

关键词：系统发育群落结构 · 群落组装 · 丰度加权 · 进化尺度 · 污水微生物组 · 零模型分析

原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.07.757245v1?rss=1