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内容形式:摘要译文
变异注释要求对序列本体(Sequence Ontology,SO)术语和人类基因组变异学会(Human Genome Variation Society,HGVS)命名法进行精确且一致的计算。为确保这两个关键方面之间实现稳健同步,我们提出了 mehari——一种采用严格“HGVS 优先”方法、以 Rust 实现的高性能变异效应预测工具。mehari 通过在评估功能后果之前,先以确定性方式将变异投影至转录本,从结构上实现 HGVS 表示与 SO 术语之间的一致。ClinVar 基准测试表明,mehari 不仅具备卓越的处理速度,并且与 Ensembl VEP 等成熟工具具有高度一致性,同时还能更精细地处理硒蛋白重编码等复杂生物学边界情形。
关键词:变异效应预测 · 变异注释 · HGVS命名法 · 序列本体 · 转录本投影 · 生物信息学工具
原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.12.724271v1?rss=1
来源出处
Mehari:高性能、严格遵循 HGVS 优先原则的变异效应预测
https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.12.724271v1?rss=1