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蛋白质组学是描绘细胞和生理过程 underlying 蛋白质景观的有力工具。基于质谱的方法不断发展，例如在 MS2 和 MS3 层面采用串联质量标签（tandem-mass-tags，TMT）同量异位标记的蛋白质组学、结合数据依赖型采集（data-dependent acquisition，DDA）或数据非依赖型采集（data-independent acquisition，DIA）蛋白质组学的无标记定量（label-free quantification，LFQ），以及借助氨基酸稳定同位素标记（stable isotope labeling with amino acids，SILAC）加标的蛋白质组学，使得跨生物学条件的定量蛋白质组比较成为可能。这五种定量蛋白质组学方法在检测覆盖度、通量和定量重现性方面各具优势。在本研究中，我们将它们视为相互正交的方法，仅保留那些在多个独立使用不同仪器的方法中均获得支持、且变化显著并具有一致方向的蛋白质候选物，以鉴定与长寿相关的高可信度蛋白质水平变化。胰岛素/胰岛素样生长因子信号（insulin/insulin-like growth factor signaling，IIS）是从秀丽隐杆线虫到人类高度保守的长寿调控通路。通过对秀丽隐杆线虫 IIS 突变体进行定量分析并开展遗传筛选，我们从系统层面揭示了与长寿相关的蛋白质组变化，并鉴定出新的长寿调控因子。这种系统性的跨方法比较也为定量蛋白质组学方法的选择提供了宝贵资源。
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化学、物理与结构生物学研究生项目，生物医学科学研究生院，贝勒医学院；
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Hanfeng Lin
1
化学、物理与结构生物学研究生项目，生物医学科学研究生院，贝勒医学院；
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Cuizhen Huang
2
霍华德·休斯医学研究所珍利亚研究园区；
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Viruthika Vallanadu
2
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Kelly Ashley
2
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Scarlett Rose Pitts
2
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Ayse Sena Mutlu
3
贝勒医学院休芬顿衰老研究中心；
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Yue Zhou
3
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Xing Ma
3
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Jong Min Choi
4
贝勒医学院分子与人类遗传学系；
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Feng Jin
5
贝勒医学院维尔娜与马尔斯·麦克莱恩生物化学与分子药理学系
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Jin Wang
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Meng C. Wang
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通讯作者：
mengwang{at}janelia.hhmi.org
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蛋白质组学是描绘细胞和生理过程所依赖蛋白质图谱的有力工具。基于质谱的方法不断发展，例如在 MS2 和 MS3 层面采用串联质谱标签（TMT）同量异位标记的蛋白质组学、结合数据依赖采集（DDA）或数据非依赖采集（DIA）的无标记定量（LFQ）蛋白质组学，以及借助稳定同位素标记氨基酸（SILAC）加标的蛋白质组学，使得能够对不同生物学条件下的定量蛋白质组进行比较。这五种定量蛋白质组学方法在覆盖度、通量和定量重现性方面各具优势。在本研究中，我们将这些方法视为相互正交的手段，仅保留那些在多种彼此独立进行仪器分析的方法中均获得支持、且具有显著性和一致变化方向的蛋白质候选物，以鉴定与长寿相关的高可信度蛋白质水平变化。胰岛素/胰岛素样生长因子信号（IIS）是从秀丽隐杆线虫到人类高度保守的长寿调控通路。通过对秀丽隐杆线虫 IIS 突变体进行定量分析并开展遗传筛选，我们从系统层面揭示了与长寿相关的蛋白质组变化，并鉴定出新的长寿调控因子。这种系统性的跨方法比较也为定量蛋白质组学方法的选择提供了宝贵资源。
利益冲突声明
作者声明存在以下竞争性经济利益：J.W. 是 Chemical Biology Probes LLC 的联合创始人。J.W. 持有 CoRegen Inc 的股份，并担任该公司的顾问。J.W. 同时也是 Fortitude Biomedicines Inc. 的联合创始人，并持有该公司的股权。其余作者声明不存在利益冲突。
已声明的资助信息
M.C.W. 获得霍华德·休斯医学研究所（HHMI）的资助。L.D. 获得 HHMI 珍利亚访问学者项目的资助。
版权
本预印本的版权所有者为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。
本文依据
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发布于 2026 年 10 月 7 日。
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Choi
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Jin
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Jin
Wang
，
Meng C.
Wang
bioRxiv
2026.10.06.757189；
DOI：
https://doi.org/10.64898/2026.10.06.757189
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Meng C.
Wang
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关键词：定量蛋白质组学 · 长寿调控 · 胰岛素/胰岛素样生长因子信号 · 秀丽隐杆线虫 · 质谱分析
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.06.757189v1?rss=1