核糖核苷酸还原酶特异性转录阻遏蛋白NrdR结合位点的突变与生物信息学分析

内容形式：摘要译文

普遍存在的转录抑制因子 NrdR 可结合于编码必需酶核糖核苷酸还原酶的操纵子启动子区域内高度保守的原核生物序列。NrdR 结合位点由两个部分回文的 16 bp 序列（NrdR 盒）组成，二者之间由一段长度为 15–16 bp 的连接序列分隔。我们评估了两个 NrdR 盒是否均为结合所必需、不同 NrdR 蛋白结合异源结合位点的倾向性，以及连接序列仅受长度限制而不受序列保守性限制的特征。鉴于我们观察到 NrdR 盒的保守序列存在若干偏差，本文利用一段合成 DNA 片段（Synt DNA）检验 NrdR 盒中各单个碱基对的保守性要求。来自放线菌 Streptomyces coelicolor 和 γ-变形菌 Escherichia coli 的 NrdR 蛋白与 Synt DNA 的结合能力，与其各自同源结合位点的结合能力相当。通过向 Synt DNA 引入单独突变，并检测 S. coelicolor 和 E. coli 的 NrdR 蛋白的结合能力，我们进一步阐明了构建 NrdR 抑制因子功能性结合位点所需满足的条件。

关键词：NrdR转录阻遏蛋白 · 核糖核苷酸还原酶 · DNA结合位点 · 启动子调控 · 位点突变 · 生物信息学分析

原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.11.724285v1?rss=1