YGEP：牦牛基因组评估与智能育种一体化网络平台|北京沫之东生物技术有限公司

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背景：牦牛（Bos grunniens）是高寒高海拔生态系统中的重要家畜，在肉、奶和绒毛生产以及生态维护方面发挥着关键作用。然而，传统牦牛育种体系面临诸多局限，包括畜群数据管理碎片化、表型采集效率低、系谱记录缺失，以及应用基因组技术的技术门槛较高等。这些因素制约了现代遗传评估方法在牦牛育种计划中的广泛应用。描述：我们开发了牦牛基因组评估平台（Yak Genomic Evaluation Platform，YGEP，https://yakbreeding.swun.edu.cn/en/），这是一个用于牦牛遗传选育与畜群管理的一体化数字系统。YGEP集成了三个核心分析模块：系谱重建、基因型填充和基因组育种值估计。在706头牦牛上的基准测试表明，基因组最佳线性无偏预测（GBLUP）对管围（CCB）的预测准确度达到r = 0.96，KBeagle结合参考面板的基因型填充准确率达到84.0%。结论：YGEP弥合了先进基因组分析技术与牦牛实际育种之间的鸿沟。通过将系谱重建、基因型填充和基因组育种值（GEBV）估计集成到一个用户友好的云平台中，YGEP有效消除了技术与数据瓶颈。总体而言，该平台为推进高寒地区家畜的数字化畜群管理与精准遗传改良提供了易于使用、可扩展且标准化的解决方案。

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背景：牦牛（ Bos grunniens ）是高海拔高寒生态系统中的重要家畜，在肉、奶和毛生产以及生态维护方面发挥着关键作用。然而，传统牦牛育种体系面临诸多局限，包括畜群数据管理碎片化、表型采集效率低、系谱记录缺失，以及应用基因组技术的技术门槛较高。这些因素限制了现代遗传评估方法在牦牛育种项目中的广泛应用。

描述：我们开发了牦牛基因组评估平台（Yak Genomic Evaluation Platform，YGEP，https://yakbreeding.swun.edu.cn/en/），这是一个用于牦牛遗传选择和畜群管理的一体化数字系统。YGEP 集成了三个核心分析模块：系谱重建、基因型填补和基因组育种值估计。基于706头牦牛的基准测试结果显示，GBLUP 对管围（cannon bone circumference，CCB）的预测准确度达到 r = 0.96；在组合参考面板下，KBeagle 的填补准确率达到84.0%。

结论：YGEP 弥合了先进基因组分析与牦牛实际育种之间的差距。通过将系谱重建、基因型填补和基因组估计育种值（GEBV）估计集成到一个用户友好的云平台中，YGEP 有效消除了技术和数据瓶颈。总体而言，该平台为推进高寒地区家畜的数字化畜群管理和精准遗传改良提供了易于使用、可扩展且标准化的解决方案。

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发布于2026年10月06日。

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