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共享细胞质中的细胞核如何组织基因表达程序以指导发育信号传导，迄今仍未得到充分理解。在本研究中，我们结合单核RNA测序、空间转录组定位和功能扰动，对斑马鱼卵黄合胞体层（yolk syncytial layer，YSL）进行了表征。YSL是一种支持胚胎发育和体轴模式形成的胚外合胞体。我们发现，YSL细胞核之间存在广泛的转录协变，揭示出沿背腹轴和动物极—植物极轴组织的协调性多基因表达程序。在YSL内，我们鉴定出一个动物极—腹侧亚区，该区域表达包括bmp16在内的多种BMP配体转录本；bmp16属于BMP2/4亚家族。我们发现，在原肠胚形成过程中，bmp16的表达完全局限于胚外组织；功能扰动结果表明，过表达bmp16足以使胚胎腹化，并且bmp16与bmp2b具有协同作用，可促进腹侧命运。YSL腹侧的Bmp转录本表达依赖于位于mxtx2下游的转录程序，并且不依赖BMP通路的自我调控而得以维持；与此同时，hhex的负调控将bmp16的表达限制在腹侧YSL。综上，这些发现表明，YSL是一种具有空间组织性的合胞体，其中协调的细胞核基因表达程序支持胚胎模式形成信号的局部来源。
空间受限于胚外合胞体中的 bmp16 促进背腹轴模式形成 | bioRxiv
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空间受限于胚外合胞体中的 bmp16 促进背腹轴模式形成
Haley Couturier， Hannah Greenfeld， Jay W Zussman， Daniel E Wagner
doi： https://doi.org/10.64898/2026.10.05.756835
Haley Couturier
加州大学旧金山分校（UCSF）
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Daniel E Wagner
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通讯作者：
daniel.wagner{at}ucsf.edu
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共享细胞质中的细胞核如何组织基因表达程序，从而指导发育信号传导，目前尚未得到充分理解。在本研究中，我们结合单核 RNA 测序、空间转录组定位和功能扰动，对斑马鱼卵黄合胞体层（yolk syncytial layer，YSL）进行了表征。YSL 是一种支持胚胎发育和模式形成的胚外合胞体。我们发现，YSL 中的细胞核之间存在广泛的转录协变，揭示出沿背腹轴和动物极—植物极轴组织的协同多基因程序。在 YSL 内部，我们鉴定出一个动物极—腹侧亚区域，该区域表达包括 bmp16 在内的多种 BMP 配体转录本；bmp16 属于 BMP2/4 亚家族。我们发现，在原肠胚形成期间，bmp16 的表达完全局限于胚外组织；功能扰动实验表明，过表达 bmp16 足以使胚胎腹化，并且 bmp16 与 bmp2b 之间具有协同作用，可促进腹侧命运。YSL 腹侧区域中 Bmp 转录本的表达依赖于 mxtx2 下游的转录程序，并且在不依赖 BMP 通路自我调节的情况下得以维持；而 hhex 的负调控则将 bmp16 的表达限制在腹侧 YSL 中。综上，这些发现确立了 YSL 是一种具有空间组织结构的合胞体，其中协调的细胞核基因表达程序支持胚胎模式形成信号的局部来源。
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发布于 2026 年 10 月 06 日。
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Haley Couturier， Hannah Greenfeld， Jay W Zussman， Daniel E Wagner
bioRxiv
2026.10.05.756835；
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.10.05.756835
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空间受限于胚外合胞体中的 bmp16 促进背腹轴模式形成
Haley Couturier， Hannah Greenfeld， Jay W Zussman， Daniel E Wagner
bioRxiv
2026.10.05.756835；
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.10.05.756835
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.05.756835v1?rss=1
🏷️ 斑马鱼卵黄合胞体层 bmp16 背腹模式化 BMP信号通路 空间转录组 胚胎发育