用于解析癌症中转录组重塑机制的RBP-miRNA调控关系图

微小RNA（micro-RNAs，miRNAs）是基因表达的关键转录后调控因子，可影响癌症的进展与结局。尽管miRNA丰度的转录调控失常是导致部分miRNA在癌症中功能异常的基础，但越来越多的研究数据表明，RNA结合蛋白（RNA-binding proteins，RBPs）是miRNA活性的主要转录后调控因子。在本研究中，我们对一组全面的RBP抑制实验、人体细胞系和组织的RNA测序数据进行分析，通过构建特征明确的miRNA家族的调控子活性模型，绘制了34种RBP与28种miRNA之间的调控联系图谱。 此外，通过对来自17种人类癌症的数千份肿瘤样本和对照样本中的miRNA丰度及其活性进行全局分析，我们发现，RBP驱动的miRNA活性调控在肿瘤中十分普遍，并促进了miRNA活性谱的异质性。我们揭示了一组能够调控抑癌性和致癌性miRNA活性的RBP，其中包括miR-29-3p、miR-17-5p和miR-19-3p。尤其值得关注的是，我们发现DDX55对miR-29-3p家族活性具有泛癌种负调控作用。miR-29-3p家族是一类具有抑癌功能的重要miRNA家族，参与了大多数人类癌症的发生发展。我们的功能研究证实，抑制DDX55能够恢复miR-29-3p的基因沉默活性，并降低癌细胞的存活率。总体而言，本研究首次开展了泛癌种层面对RBP与miRNA之间功能性调控联系的研究，并突出展示了可通过干预性调控其活性、作为重新编程癌症中异常miRNA活性的新策略的RBP。

微小RNA（miRNAs）是基因表达的关键转录后调控因子，可影响癌症进展及临床结局。尽管miRNA丰度的转录调控失常是导致部分miRNA在癌症中功能异常的基础，但越来越多的研究数据表明，RNA结合蛋白（RBPs）是miRNA活性的主要转录后调控因子。在本研究中，我们利用一套涵盖多种RBP抑制实验、人体细胞系和组织的综合RNA测序数据，对特征明确的miRNA家族的调控子活性进行建模，绘制了34种RBP与28种miRNA之间的调控联系图谱。此外，通过对来自17种人类癌症的数千份肿瘤样本和对照样本中的miRNA丰度及其活性进行全局分析，我们发现，RBP驱动的miRNA活性调控在肿瘤中十分普遍，并促成了miRNA活性谱的异质性。我们鉴定出一组能够调控抑癌性和致癌性miRNA活性的RBP，其中包括miR-29-3p、miR-17-5p和miR-19-3p。特别值得关注的是，我们发现DDX55在泛癌层面负向调控miR-29-3p家族的活性；miR-29-3p家族是一个具有关键抑癌功能、参与大多数人类癌症的miRNA家族。我们的功能研究证实，抑制DDX55能够恢复miR-29-3p的基因沉默活性，并降低癌细胞的存活率。总体而言，本研究首次在泛癌层面考察了RBP与miRNA之间的功能性调控联系，并揭示了可通过干预性调节其活性、作为重新编程癌症中异常miRNA活性的新策略的RBP。

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🏷️ RNA结合蛋白 微小RNA调控 转录后调控 癌症转录组重塑 泛癌种分析 DDX55-miR-29-3p轴