Meta2Data：面向大规模微生物组数据再分析的自动化数据处理

Meta2Data 是一个采用 Python 和 Bash 实现的模块化、高度自动化流程，用于公共微生物组测序数据的检索、标准化与处理。该流程根据用户提供的关键词或 BioProject/BioSample 标识符，从包括 INSDC 和 CNCB 在内的主要公共数据库中检索元数据。检索到的元数据首先利用同义词词典进行标准化，随后接受人工整理。在经过整理的元数据基础上，Meta2Data 下载相应的原始测序数据，并采用基于 DADA2 或 VSEARCH 的标准化流程对其进行处理。该流程同时支持单靶区和多靶区数据集，并为下游微生物群落分析生成整合的特征表、分类学注释结果和系统发育树。 **可用性与实现** Meta2Data 可免费获取，网址为 https://github.com/LinyangSun/Meta2Data；同时已存档于 Zenodo，网址为 https://doi.org/10.5281/zenodo.20670433

Meta2Data 是一个采用 Python 和 Bash 实现的模块化、高度自动化流程，用于公共微生物组测序数据的检索、标准化与处理。该流程可根据用户提供的关键词或 BioProject/BioSample 标识符，从包括 INSDC 和 CNCB 在内的主要公共数据库中检索元数据。检索到的元数据首先利用同义词词典进行标准化，随后接受人工整理。基于整理后的元数据，Meta2Data 下载相应的原始测序数据，并采用基于 DADA2 或 VSEARCH 的标准化流程进行处理。该流程同时支持单靶区和多靶区数据集，并生成可用于后续微生物群落分析的整合特征表、分类学注释和系统发育树。

**可用性与实现** Meta2Data 可免费获取，项目地址为 https://github.com/LinyangSun/Meta2Data，并已存档于 Zenodo：https://doi.org/10.5281/zenodo.20670433

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.01.732036v1?rss=1

🏷️ 微生物组学 宏基因组数据处理 元数据标准化 高通量测序 生物信息学流程