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传统的野生动物兽医病理学调查通常综合临床症状、肉眼及显微病变、微生物培养和PCR结果，判定死亡的主要原因。然而，这些方法可能无法全面揭示宿主更广泛的微生物群落。我们采用宏转录组测序，对经尸检的海龟潜在病原组进行表征，并将所得结果与相应的兽医病理学报告进行比较。我们从澳大利亚新南威尔士州沿海地区的76只海龟中采集了组织样本，样本涵盖三种海龟，即绿海龟（Chelonia mydas）、玳瑁（Eretmochelys imbricata）和红海龟（Caretta caretta）。报告记录的死亡原因包括传染性疾病和创伤等。我们鉴定出多种寄生虫，包括属于Neospirochis、Hapalotrema、Paraorgymatobothrium、Eimeria和Callitetrarhynchus属的寄生虫；同时还检测到包括Aeromonas、Clostridium和Vibrio属在内的细菌。此外，还鉴定出属于星状病毒科（Astroviridae）、杯状病毒科（Caliciviridae）、肝炎病毒科（Hepaciviridae）、戊型肝炎病毒科（Hepeviridae）、尼亚病毒科（Nyamivirdae）、正黏病毒科（Orthomyxoviridae）、双链RNA病毒科（Picobirnaviridae）和弹状病毒科（Rhabdoviridae）的新型病毒。在病理学报告记录有传染性疾病的病例中，我们通常观察到较高的病原体序列读数，这与报告中列出的主要诊断相一致。然而，我们还检测到一系列偶发性感染，涉及真核寄生虫、细菌和病毒。在海龟中检测到的感染性病原体具有较高多样性，这表明所观察到的疾病结局不太可能由单一病原体驱动，而更可能是宿主健康状况、病原组与环境胁迫因素之间复杂相互作用的结果。我们讨论了这些发现对海龟健康和保护工作的潜在影响。
海龟中共同感染和偶发感染的宏转录组学鉴定揭示了复杂的疾病病因学 | bioRxiv
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# 海龟中共同感染和偶发感染的宏转录组学鉴定揭示了复杂的疾病病因学
Lauren Lim， Bethan Lang， Heather Fenton， Karrie C Rose， Jane Hall， 查看 ORCID 个人资料 Edward C Holmes
doi： https://doi.org/10.64898/2026.10.02.753670
Lauren Lim 1 悉尼大学； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在持有人为作者/资助者，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。
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发布于 2026 年 10 月 6 日。
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海龟中共同感染和偶发感染的宏转录组学鉴定揭示了复杂的疾病病因学
Lauren Lim， Bethan Lang， Heather Fenton， Karrie C Rose， Jane Hall， Edward C Holmes
bioRxiv 2026.10.02.753670； doi： https://doi.org/10.64898/2026.10.02.753670
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海龟中共同感染和偶发感染的宏转录组学鉴定揭示了复杂的疾病病因学
Lauren Lim， Bethan Lang， Heather Fenton， Karrie C Rose， Jane Hall， Edward C Holmes
bioRxiv 2026.10.02.753670； doi： https://doi.org/10.64898/2026.10.02.753670
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.02.753670v1?rss=1
🏷️ 宏转录组学 海龟疾病 病原组分析 共同感染 野生动物健康 病原体多样性