对角质层颜色的选择产生了全基因组响应,但该响应并未定位于果蝇中已知的主要基因

由 root 提交于 周二, 10/06/2026 - 20:47
复杂性状常被认为具有高度多基因性,尤其是在定位研究未能确定其遗传位点时;然而,未能识别出主效基因也可能反映的是统计效能不足。果蝇的表皮颜色为区分这两种情况提供了一个天然的检验体系,因为在自然群体中,具有较大效应的基因处于分离状态。我们在两个黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)群体和两个拟果蝇(D. simulans)群体中,连续16代对胸部三叉纹的深色和浅色进行选择,随后采用混合群体测序,扫描每个基因组,以检测选择系与对照系之间的等位基因频率分化。 在每个群体中,选择均导致全基因组范围内等位基因频率发生强烈变化,其幅度超过了遗传漂变的预期。模拟结果表明,我们的实验设计检测主效基因的统计效能较低,这或许解释了为何未观察到定位于已知颜色基因的峰。我们进一步表明,每个基因组中位于3L染色体上的一个高度显著峰,实际上是由混合测序的成年雌蝇样本中卵壳基因扩增造成的伪象。这是此前尚未有报道的、池式测序研究中产生错误信号的一种来源。 cosmopolitan 倒位在携带这些倒位的一个群体中随选择发生了频率变化,但直接检验表明,它们并未放大全基因组噪声,这与该领域的一种普遍假设相矛盾。 总体而言,这些结果表明,即使某一性状具有已知的主效基因,也可能产生弥散的、多基因型响应;同时,研究结果定量解释了为何“进化并重新测序”(evolve-and-resequence)设计即便面对遗传结构已得到充分表征的性状,仍可能无法实现遗传位点定位。

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# 对果蝇体表颜色的选择产生了全基因组响应,但该响应并不定位于已知的主效基因

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Sarah N. Ruckman, Anthony D. Long

doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.29.755441

Sarah N. Ruckman 加利福尼亚大学欧文分校

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发布于2026年10月5日。

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Sarah N. Ruckman, Anthony D. Long

bioRxiv 2026.09.29.755441; doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.29.755441

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Sarah N. Ruckman, Anthony D. Long

bioRxiv 2026.09.29.755441; doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.29.755441


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.29.755441v1?rss=1

🏷️ 果蝇表皮颜色 人工选择 全基因组响应 混合群体测序 多基因性状 进化与重新测序