茉莉酸诱导的MYC2结合组扩展发生于预先配置的染色质景观中

由 root 提交于 周六, 10/03/2026 - 00:47
转录因子(TF)MYC2是茉莉酸(JA)信号传导的核心调控因子,然而,迄今对其全基因组占据情况的表征主要依赖于表达带标签MYC2蛋白的转基因株系,因此,内源MYC2顺式调控组(cistrome)的动态变化仍未得到解析。在本研究中,我们利用MYC2特异性抗体,确定了拟南芥(Arabidopsis thaliana)在基础条件和JA诱导条件下的野生型MYC2顺式调控组。内源MYC2在对照条件下表现出极低的全基因组占据水平,但在JA处理后发生显著扩展,产生了3,000多个结合位点,这些位点富集于JA信号网络的核心组分。顺式调控组的扩展与MYC2蛋白丰度的增加相一致;与此同时,在一个转基因株系中,MYC2基础水平的升高与即使在缺乏JA的条件下也存在广泛MYC2占据相关联,从而支持MYC2丰度与其全基因组结合之间存在剂量依赖关系。尽管顺式调控组发生了广泛扩展并伴随转录重编程,ATAC-seq结果显示,JA处理后染色质可及性的重塑极为有限。MYC2的募集主要发生在预先存在的可及染色质区域内,而这些区域在myc2 myc3 myc4突变体中总体上仍保持完整。综上,我们的研究揭示,JA依赖的内源MYC2顺式调控组扩展发生于一个大体预先建立的染色质可及组(accessome)之中,并确定MYC2剂量是决定其全基因组占据范围的重要因素。

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茉莉酸诱导的 MYC2 顺式调控组扩展发生于预先配置的染色质景观中

Linkan Dash,Moonia Ammari,Aanchal Choudhary,Kashif Maseh,Moorthy Gnanarajah,Jeevika Gupta,Mark Zander

doi:

https://doi.org/10.64898/2026.10.01.755910

Linkan Dash 1 Waksman 微生物学研究所,植物生物学系,罗格斯大学新泽西州立大学,美国新泽西州皮斯卡特维,邮编 08854;

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Moonia Ammari 1 Waksman 微生物学研究所,植物生物学系,罗格斯大学新泽西州立大学,美国新泽西州皮斯卡特维,邮编 08854;

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Aanchal Choudhary 2 免疫生物学系,洛桑大学,瑞士埃帕林日

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Kashif Maseh 1 Waksman 微生物学研究所,植物生物学系,罗格斯大学新泽西州立大学,美国新泽西州皮斯卡特维,邮编 08854;

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Moorthy Gnanarajah 1 Waksman 微生物学研究所,植物生物学系,罗格斯大学新泽西州立大学,美国新泽西州皮斯卡特维,邮编 08854;

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Jeevika Gupta 1 Waksman 微生物学研究所,植物生物学系,罗格斯大学新泽西州立大学,美国新泽西州皮斯卡特维,邮编 08854;

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Mark Zander 1 Waksman 微生物学研究所,植物生物学系,罗格斯大学新泽西州立大学,美国新泽西州皮斯卡特维,邮编 08854;

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通信作者:

mzander{at}waksman.rutgers.edu

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转录因子(TF)MYC2 是茉莉酸(JA)信号传导的核心调控因子,但迄今对其全基因组占据情况的研究主要采用表达带标签 MYC2 蛋白的转基因品系,因此内源性 MYC2 顺式调控组的动态变化仍未得到解析。在本研究中,我们利用 MYC2 特异性抗体,界定了拟南芥在基础条件和 JA 诱导条件下的野生型 MYC2 顺式调控组。内源性 MYC2 在对照条件下表现出极低的全基因组占据水平,但在 JA 处理后发生显著扩展,形成超过 3,000 个结合位点,并且这些位点富集于 JA 信号网络的核心组分。顺式调控组的扩展与 MYC2 蛋白丰度增加相一致;而在一个转基因品系中,MYC2 基础水平升高,即使在缺乏 JA 的情况下也与广泛的 MYC2 占据相关,这支持 MYC2 丰度与其全基因组结合之间存在剂量依赖关系。尽管顺式调控组发生了广泛扩展并伴随转录重编程,ATAC-seq 结果显示,JA 处理后染色质可及性仅发生了极为有限的重塑。MYC2 的募集主要发生在预先存在的开放染色质区域内,而这些区域在 myc2 myc3 myc4 突变体中总体上仍保持完整。综上所述,我们的研究揭示,JA 依赖性的内源性 MYC2 顺式调控组扩展发生于一个在很大程度上预先建立的可及组内,并确定 MYC2 剂量是决定其全基因组占据范围的重要因素。

利益冲突声明

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美国国家科学基金会(NSF),IOS-2339927

版权

本预印本的。

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Linkan Dash,Moonia Ammari,Aanchal Choudhary,Kashif Maseh,Moorthy Gnanarajah,Jeevika Gupta,Mark Zander

bioRxiv

2026.10.01.755910;

doi:

https://doi.org/10.64898/2026.10.01.755910

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茉莉酸诱导的 MYC2 顺式调控组扩展发生于预先配置的染色质景观中

Linkan Dash,Moonia Ammari,Aanchal Choudhary,Kashif Maseh,Moorthy Gnanarajah,Jeevika Gupta,Mark Zander

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2026.10.01.755910;

doi:

https://doi.org/10.64898/2026.10.01.755910


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.01.755910v1?rss=1

🏷️ 茉莉酸信号传导 MYC2转录因子 顺式调控组 染色质可及性 转录调控