- 3 次围观
脑脊液（cerebrospinal fluid，CSF）中含有来源于脑的蛋白质，可作为阿尔茨海默病（Alzheimer’s disease，AD）及其他神经退行性疾病的生物标志物。然而，将蛋白质强度转化为疾病信号仍是一项挑战，因为当仅对脑脊液进行分析时，生理因素驱动的蛋白质在脑脊液不同亚区室之间的定位变化会被掩盖。当同时测量细胞外囊泡（extracellular vesicles，EVs）等亚区室数据时，分别且平行地分析EVs和脑脊液，可能会掩盖二者共同的疾病信号。在此，我们提出一种整合的矩阵分解方法，用于结合配对脑脊液与暴露磷脂酰丝氨酸的细胞外囊泡及纳米颗粒（phosphatidylserine-exposed extracellular vesicles and nanoparticles，EVps）中的蛋白质组学信号。在由48名参与者组成的ROS/MAP队列中，整合脑脊液与EVps信号提高了不同区室之间的生物学一致性，并增加了可区分AD参与者与对照者的候选蛋白质数量。值得注意的是，该联合信号鉴定出的脑相关生物标志物候选物数量，与采用大得多的队列开展的研究相当。通过证明整合脑脊液与EVps蛋白质组能够最大限度地利用有限样本中的信息，该框架为在神经退行性疾病研究中日益受到重视的两个区室开展更高效的生物标志物发现提供了一条途径。
整合脑脊液与细胞外囊泡蛋白质组，通过捕获跨区室共享变异增强生物标志物发现 | bioRxiv
跳转至主要内容
主页 关于 投稿 提醒/RSS 搜索此关键词 高级搜索 最新结果
# 整合脑脊液与细胞外囊泡蛋白质组，通过捕获跨区室共享变异增强生物标志物发现
查看 ORCID 个人资料 Bianca R. P. Brown
查看 ORCID 个人资料 Xiaoting Li
Monica R. Grasty
查看 ORCID 个人资料 Andrew D. Miranker
查看 ORCID 个人资料 Gamze Gursoy
doi： https://doi.org/10.64898/2026.09.30.754912
Bianca R. P. Brown 1 耶鲁大学； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者 Bianca R. P. Brown 的 ORCID 记录
通讯作者： biancarpalmerbrown{at}gmail.com
Xiaoting Li 2 剑桥大学 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者 Xiaoting Li 的 ORCID 记录
Monica R. Grasty 1 耶鲁大学； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Andrew D. Miranker 1 耶鲁大学； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者 Andrew D. Miranker 的 ORCID 记录
Gamze Gursoy 2 剑桥大学 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者 Gamze Gursoy 的 ORCID 记录
## 摘要
信息/历史 指标 补充材料 数据/代码 预览 PDF
## 摘要
脑脊液（CSF）含有来源于脑部的蛋白质，可被用作阿尔茨海默病（AD）及其他神经退行性疾病的生物标志物。然而，将蛋白质强度转化为疾病信号仍然是一项挑战，因为当单独分析脑脊液时，由生理因素驱动的蛋白质在脑脊液不同亚区室之间的定位变化会被掩盖。当同时测量细胞外囊泡（EVs）等亚区室数据时，对细胞外囊泡和脑脊液分别进行但彼此平行的分析，可能会掩盖二者共享的疾病信号。在此，我们提出一种整合式矩阵分解方法，将配对脑脊液与暴露磷脂酰丝氨酸的细胞外囊泡及纳米颗粒（EVps）的蛋白质组学信号相结合。在包含48名参与者的ROS/MAP队列中，整合脑脊液与EVps信号提高了不同区室之间的生物学一致性，并增加了区分AD参与者与对照者的候选蛋白质数量。值得注意的是，该联合信号识别出的脑相关候选生物标志物数量，与采用规模大得多的队列开展的研究一样多。通过证明整合脑脊液与EVps蛋白质组能够最大限度地利用有限样本中的信息，本框架为在神经退行性疾病研究中日益受到重视的两个区室之间开展更高效的生物标志物发现提供了一条路径。
## 利益冲突声明
作者已声明不存在利益冲突。
## 脚注
https://github.com/G2Lab/Alzheimers_CSF_EV_Proteomics_Integration
## 资助信息声明
美国国家老龄化研究所，R01AG068285
Warren Alpert基金会， https://ror.org/041ztcd61
## 版权
本预印本的。
本文依据 CC-BY-ND 4.0国际许可协议 公开发布。
返回顶部 上一篇 下一篇
发布于2026年10月2日。
下载PDF 补充材料 数据/代码 电子邮件
感谢您有意传播bioRxiv上的内容。
您的电子邮件地址 *
您的姓名 *
发送至 *
请输入多个地址，每行一个或使用逗号分隔。
您即将发送以下内容：
整合脑脊液与细胞外囊泡蛋白质组，通过捕获跨区室共享变异增强生物标志物发现
邮件主题 （您的姓名）从bioRxiv网站转发了一个页面给您
邮件正文 （您的姓名）认为您可能会对bioRxiv网站上的这一页面感兴趣。
您的个人留言
验证码
此问题用于测试您是否为人类访客，并防止自动垃圾邮件提交。
分享
# 整合脑脊液与细胞外囊泡蛋白质组，通过捕获跨区室共享变异增强生物标志物发现
Bianca R. P. Brown Xiaoting Li Monica R. Grasty Andrew D. Miranker Gamze Gursoy
bioRxiv 2026.09.30.754912； doi： https://doi.org/10.64898/2026.09.30.754912
分享本文：
复制 引用工具
# 整合脑脊液与细胞外囊泡蛋白质组，通过捕获跨区室共享变异增强生物标志物发现
Bianca R. P. Brown Xiaoting Li Monica R. Grasty Andrew D. Miranker Gamze Gursoy
bioRxiv 2026.09.30.754912； doi： https://doi.org/10.64898/2026.09.30.754912
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.30.754912v1?rss=1
🏷️ 脑脊液蛋白质组学 细胞外囊泡 矩阵分解 生物标志物发现 阿尔茨海默病 神经退行性疾病