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背景/目的:在高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)中,肿瘤细胞对细胞毒性治疗的耐受能力及其复发,主要由卵巢癌干细胞(CSCs)驱动。CSCs是肿瘤内部维持干细胞样特征的一类细胞群,具有产生转移并驱动药物耐药的能力。鉴于CSCs信号传导的复杂性,以及发育过程中存在差异性异构体使用的新兴证据,我们提出假设:CSCs具有患者特异性的异质性图谱,并通过利用异构体多样性来维持干性、转移能力和药物耐药性。 方法:我们对3例患者来源的HGSOC(PD-HGSOC)样本进行RNA测序,通过比较标准培养条件下的细胞与CSCs,探究其干性和分化状态。分别在基因水平和异构体水平对数据进行分析,以识别患者特异性的CSC特征,并阐明癌症相关干性和可塑性的机制。 结果:CSCs表现出更高的干性特征,并在不同PD-HGSOC样本中识别出差异表达的基因集。我们注意到,每位患者均具有调控干性表型的独特基因子集,这提示CSCs的发生与维持可能存在多种机制。此外,大量基因水平的表达变化由单一优势异构体的差异表达所驱动。重要的是,我们的异构体水平分析能够识别出基因水平表达分析无法检测到的差异性异构体使用模式。 结论:耐化疗、转移和自我更新等CSC表型在不同患者之间具有保守性,但其形成主要源于患者特异性的基因和异构体调控程序。这种CSC异质性反映了患者中观察到的异质性,在制定针对HGSOC的精准医学策略时应对其进行进一步评估。
癌症干细胞转录组特征揭示患者间异质性,凸显针对患者特异性卵巢癌靶点的必要性 | bioRxiv
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# 癌症干细胞转录组特征揭示患者间异质性,凸显针对患者特异性卵巢癌靶点的必要性
Matthew S. Jung,Lindsey J. Davis,Audrey A. Birdwell,Jisun Kang,Colleen Feng,Amelia Pi,Sue Chin Lee,Sandra Davern,Rachel Patton McCord,Junming Yue,Wenjing Zhang,Won-Young Choi,Rachel S. Perkins
DOI: https://doi.org/10.64898/2026.09.30.755773
Matthew S. Jung¹ 田纳西大学健康科学中心
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本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议 公开提供。
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发布于 2026 年 10 月 2 日。
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Matthew S. Jung,Lindsey J. Davis,Audrey A. Birdwell,Jisun Kang,Colleen Feng,Amelia Pi,Sue Chin Lee,Sandra Davern,Rachel Patton McCord,Junming Yue,Wenjing Zhang,Won-Young Choi,Rachel S. Perkins
bioRxiv 2026.09.30.755773; DOI: https://doi.org/10.64898/2026.09.30.755773
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癌症干细胞转录组特征揭示患者间异质性,凸显针对患者特异性卵巢癌靶点的必要性
Matthew S. Jung,Lindsey J. Davis,Audrey A. Birdwell,Jisun Kang,Colleen Feng,Amelia Pi,Sue Chin Lee,Sandra Davern,Rachel Patton McCord,Junming Yue,Wenjing Zhang,Won-Young Choi,Rachel S. Perkins
bioRxiv 2026.09.30.755773; DOI: https://doi.org/10.64898/2026.09.30.755773
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.30.755773v1?rss=1
🏷️ 卵巢癌干细胞 高级别浆液性卵巢癌 转录组测序 异构体多样性 患者间异质性 精准医学