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CD8 T细胞是介导抗肿瘤免疫的关键细胞，但其在急性髓系白血病（AML）骨髓微环境中的分化状态和克隆架构仍未得到充分阐明。我们利用质谱流式细胞术，对46例初诊AML患者的骨髓样本进行了高维免疫分析，以探究其微环境和T细胞状态。我们进一步采用单细胞RNA测序和T细胞受体（TCR）测序，解析CD8 T细胞的表型、转录状态及克隆架构。AML相关CD8 T细胞倾向于终末分化的再表达CD45RA的效应记忆T细胞（TEMRA），而经典的耗竭性T细胞群体较为少见。功能研究显示，TEMRA CD8 T细胞在体外刺激后能够强烈产生IFN-γ和TNF。克隆扩增主要集中于TEMRA细胞群。将TCR序列与已知病毒表位进行比较后发现，少数扩增的克隆型具有病毒特异性，而大多数高度扩增的克隆型特异性尚不明确，其中可能包括AML特异性T细胞。差异基因表达分析显示，克隆扩增过程中存在共同的细胞毒性效应程序，但其活化特征存在分化：病毒特异性克隆上调了经典T细胞受体信号通路相关基因，而特异性未知的扩增克隆则表现出自然杀伤（NK）细胞受体相关基因的富集。这些基因构成了白血病相关NK免疫（LaNKi）评分；与泛癌肿瘤浸润淋巴细胞相比，该评分在一个独立的AML数据集中升高。这些发现界定了AML初诊时骨髓中CD8 T细胞的分化图谱和克隆架构，并提示AML中的T细胞功能障碍不同于经典的活化与耗竭模式。
AML中克隆扩增的CD8 T细胞采用区别于经典耗竭的类NK程序 | bioRxiv
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# AML中克隆扩增的CD8 T细胞采用区别于经典耗竭的类NK程序
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Yunli E Chu， Matthew A Cottam， Chad R Potts， Thomas Gracie， Ciarra Polsley， Justin A Cartailler， Michael R Savona， Rui Lu， Stanley C Lee， Robert S Welner， P Brent Ferrell
doi： https://doi.org/10.64898/2026.09.30.755147
Yunli E Chu¹ 范德比尔特大学医学中心； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者 Yunli E Chu 的 ORCID 记录
Matthew A Cottam¹ 范德比尔特大学医学中心； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者 Matthew A Cottam 的 ORCID 记录
Chad R Potts¹ 范德比尔特大学医学中心； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者 Chad R Potts 的 ORCID 记录
Thomas Gracie¹ 范德比尔特大学医学中心； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者 Thomas Gracie 的 ORCID 记录
Ciarra Polsley¹ 范德比尔特大学医学中心
Justin A Cartailler² 西北大学； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者 Justin A Cartailler 的 ORCID 记录
Michael R Savona¹ 范德比尔特大学医学中心； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者 Michael R Savona 的 ORCID 记录
Rui Lu³ 阿拉巴马大学伯明翰分校； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者 Rui Lu 的 ORCID 记录
Stanley C Lee⁴ 弗雷德·哈钦森癌症中心 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者 Stanley C Lee 的 ORCID 记录
Robert S Welner³ 阿拉巴马大学伯明翰分校 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者 Robert S Welner 的 ORCID 记录
P Brent Ferrell¹ 范德比尔特大学医学中心； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者 P Brent Ferrell 的 ORCID 记录
通讯作者： brent.ferrell{at}vumc.org
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## 摘要
CD8 T细胞是介导抗肿瘤免疫的关键细胞，但其在急性髓系白血病（AML）骨髓微环境中的分化状态和克隆构成仍未得到充分阐明。我们利用质谱流式技术对46例初诊AML患者的骨髓样本进行了高维免疫分析，以探究其微环境和T细胞状态。我们采用单细胞RNA测序和T细胞受体（TCR）测序，界定CD8 T细胞的表型、转录状态及克隆构成。AML相关CD8 T细胞偏向于终末分化的效应记忆T细胞再表达CD45RA（TEMRA），而经典耗竭T细胞群体则较为罕见。功能研究显示，TEMRA CD8 T细胞在体外刺激后能够强烈产生IFNγ和TNFα。克隆扩增主要集中于TEMRA区室。通过将TCR序列与已知病毒表位进行比对，我们鉴定出一小部分扩增的病毒特异性克隆型；而大多数高度扩增的克隆型特异性未知，可能包括AML特异性T细胞。差异基因表达分析显示，克隆扩增过程中存在共同的细胞毒性效应程序，但激活特征存在分化：病毒特异性克隆上调了经典T细胞受体信号通路相关基因，而特异性未知的扩增克隆则表现出自然杀伤（NK）受体相关基因富集。这些基因构成了白血病相关NK免疫（LaNKi）评分；与泛癌肿瘤浸润淋巴细胞相比，该评分在一个独立的AML数据集中升高。这些发现界定了AML初诊骨髓中CD8 T细胞的分化图谱和克隆构成，并提示AML中的T细胞功能障碍有别于经典的激活和耗竭范式。
## 利益冲突声明
与本研究无关：PBF曾从诺华公司获得研究经费。MRS持有Empath、Karyopharm和Ryvu公司的股权，曾获得Astex、Incyte和Prelude的研究资助，并曾为Calytrix、BMS、Epigenetix、Geron、PharmaEssentia和Rigel提供咨询或顾问服务。其他所有作者均声明不存在利益冲突。
## 资助方信息声明
Mark癌症研究基金会， https://ror.org/00v7th354
Edward P. Evans基金会
Gabrielle's Angel癌症研究基金会， https://ror.org/04aj0cy60
诺华公司（美国）， https://ror.org/028fhxy95
美国退伍军人事务部， https://ror.org/05rsv9s98
美国癌症协会， https://ror.org/02e463172
美国国家癌症研究所， https://ror.org/040gcmg81
美国国家心肺血液研究所， https://ror.org/012pb6c26
## 版权
本预印本的。
保留所有权利。未经许可不得以任何方式再利用。
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发布于2026年10月2日。
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Yunli E Chu， Matthew A Cottam， Chad R Potts， Thomas Gracie， Ciarra Polsley， Justin A Cartailler， Michael R Savona， Rui Lu， Stanley C Lee， Robert S Welner， P Brent Ferrell
bioRxiv 2026.09.30.755147； doi： https://doi.org/10.64898/2026.09.30.755147
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AML中克隆扩增的CD8 T细胞采用区别于经典耗竭的类NK程序
Yunli E Chu， Matthew A Cottam， Chad R Potts， Thomas Gracie， Ciarra Polsley， Justin A Cartailler， Michael R Savona， Rui Lu， Stanley C Lee， Robert S Welner， P Brent Ferrell
bioRxiv 2026.09.30.755147； doi： https://doi.org/10.64898/2026.09.30.755147
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.30.755147v1?rss=1
🏷️ 急性髓系白血病 CD8 T细胞 TEMRA细胞 T细胞克隆扩增 单细胞RNA测序 NK样免疫程序