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缰核（Hb）是一个位于上丘脑中线的小型结构，在奖赏加工和情绪调节中发挥关键作用，并与包括抑郁症和成瘾在内的多种复杂脑疾病相关。尽管模型生物中的缰核分子解剖学特征已得到充分表征，但人脑缰核的组织结构仍知之甚少，包括空间组织的外侧缰核（LHb）和内侧缰核（MHb）细胞类型的转录组学及表观遗传学特征。在本研究中，我们结合多组学单核测序（snMultiome）和空间分辨转录组学，构建了人类缰核的高分辨率空间分子图谱。基于与啮齿动物和斑马鱼之间的转录组保守性，我们对4种MHb神经元细胞类型和5种LHb神经元细胞类型中的基因表达及染色质可及性进行了测量。我们鉴定出与GABA能和谷氨酸能信号传导相关的细胞类型特异性分子特化，以及与抑郁症和成瘾相关的开放染色质区域、转录因子与靶基因之间的调控关系。高分辨率空间转录组学确定了LHb内异质性细胞亚群的解剖位置，其中包括两个推定的LHb抑制性细胞群。我们进一步刻画了缰核神经元与胶质细胞亚型之间的细胞类型关系，并预测了LHb与MHb神经元之间的配体—受体相互作用。最后，我们描绘了富集精神疾病遗传风险相关基因的缰核细胞类型及空间域，并发现其中最强的富集位于MHb。总体而言，本研究所生成的数据及分析结果解析了人类缰核的空间分子组织结构，并揭示了其与神经精神疾病之间的分子遗传学关联。
人类缰核的多组学空间定位揭示内侧和外侧亚区的分子与解剖组织结构 | bioRxiv
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Kristen R. Maynard
DOI：
https://doi.org/10.64898/2026.09.30.755667
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缰核（habenula，Hb）是一个位于上丘脑中线的小型结构，在奖赏加工和情绪调节中发挥关键作用，并与包括抑郁症和成瘾在内的多种复杂脑疾病有关。尽管模式生物中的缰核分子解剖学特征已得到充分阐明，但人脑缰核的组织结构仍知之甚少，尤其是空间组织的外侧缰核（lateral habenula，LHb）和内侧缰核（medial habenula，MHb）细胞类型的转录组学与表观遗传学特征。本文结合多组学单核测序（snMultiome）和空间分辨转录组学技术，构建了人类缰核的高分辨率空间分子图谱。我们测定了4种MHb神经元细胞类型和5种LHb神经元细胞类型的基因表达与染色质可及性；这些细胞类型依据其与啮齿动物和斑马鱼的转录组保守性进行界定。我们鉴定出与GABA能和谷氨酸能信号传导相关的细胞类型特异性分子特化，以及与抑郁症和成瘾相关的开放染色质区域、转录因子与靶基因之间的调控关系。高分辨率空间转录组学确定了LHb中异质性细胞亚群的解剖学位置，其中包括LHb内两个推定的抑制性细胞群。我们进一步刻画了缰核神经元与不同胶质细胞亚型之间的细胞类型关系，并预测了LHb与MHb神经元之间的配体—受体相互作用。最后，我们描绘了与精神障碍遗传风险相关基因富集的缰核细胞类型和空间区域，其中最强的富集出现在MHb。总体而言，本研究所生成的数据与分析结果解析了人类缰核的空间分子组织结构，并揭示了其与神经精神疾病之间的分子—遗传学关联。
利益冲突声明
脚注
https://research.libd.org/Hb_multiome/
https://github.com/LieberInstitute/Hb_multiome
https://github.com/LieberInstitute/Habenula_Visium
资助者信息声明
美国国立卫生研究院，R01DA055823
版权
。
本文依据 CC-BY-NC 4.0 国际许可协议提供。
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发布于2026年10月2日。
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Kelsey D. Montgomery，
Jonathan M. Werner，
Nicholas J. Eagles，
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Ruth Zhang，
Sarah E. Maguire，
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Ryan A. Miller，
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Joel E. Kleinman，
Thomas M. Hyde，
Brion S. Maher，
Leonardo Collado-Torres，
Kristen R. Maynard
bioRxiv
2026.09.30.755667；
DOI：
https://doi.org/10.64898/2026.09.30.755667
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Kelsey D. Montgomery，
Jonathan M. Werner，
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Chunyu Liu，
Cynthia S. Cardinault，
Svitlana V. Bach，
Atharv Chandra，
Ruth Zhang，
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Rahul A. Bharadwaj，
Joel E. Kleinman，
Thomas M. Hyde，
Brion S. Maher，
Leonardo Collado-Torres，
Kristen R. Maynard
bioRxiv
2026.09.30.755667；
DOI：
https://doi.org/10.64898/2026.09.30.755667
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.30.755667v1?rss=1
🏷️ 人类缰核 空间转录组学 单核多组学 神经元细胞类型 表观遗传学 神经精神疾病