人类CCR4-NOT复合体在mRNA去腺苷酸化与降解中的全局调控功能

由 root 提交于 周五, 10/02/2026 - 20:47
聚腺苷酸(poly(A))尾的缩短启动了mRNA降解,而人类CCR4-NOT复合体是细胞质中主要的去腺苷酸化酶。尽管其各亚基已得到鉴定,但这些亚基在细胞中的功能尚未得到全面评估。我们分别耗竭了每个CCR4-NOT亚基,并测定了其对全转录组的影响。CCR4-NOT调控来自数千个基因的转录本,其中许多转录本在细胞中与该复合体相关。不同转录本群体根据该复合体的模块化组织方式表现出不同的响应,而其中一些转录本则对特定亚基呈现独特的响应。聚腺苷酸尾分析显示,在这些细胞中,CNOT7和CNOT8去腺苷酸化酶是调控聚腺苷酸尾长度的主要因子。CCR4-NOT的靶转录本富集于包括细胞增殖、细胞凋亡、应激反应以及癌症相关过程在内的调控通路中。生物信息学分析鉴定出与CCR4-NOT调控相关的序列决定因素和候选招募因子。这些结果界定了CCR4-NOT介导的mRNA降解的广度与特异性,并为解析其调控机制及生物学作用提供了资源。

agoldstr{at}umn.edu

摘要

信息/历史

指标

补充材料

预览 PDF

摘要

poly(A)尾的缩短启动mRNA降解,而人类CCR4–NOT复合体是细胞质中主要的去腺苷酸化酶。尽管其各个亚基已经得到界定,但它们在细胞中的功能尚未得到全面评估。我们分别耗竭了CCR4–NOT复合体的每个亚基,并测定了其对全转录组的影响。CCR4–NOT调控来自数千个基因的转录本,其中许多转录本在细胞中与该复合体相关。不同转录本群体依据该复合体的模块化组织方式呈现出不同的响应,而其中一些亚群则表现出针对特定亚基的独特响应。poly(A)尾分析表明,在这些细胞中,CNOT7和CNOT8去腺苷酸化酶是调控poly(A)尾长度的主要因子。CCR4–NOT靶标富集于包括细胞增殖、细胞凋亡、应激反应以及癌症相关过程在内的调控通路中。生物信息学分析鉴定出与CCR4–NOT调控相关的序列决定因素和候选募集因子。这些结果界定了CCR4–NOT介导的mRNA降解的广度与特异性,并为解析其调控机制和生物学功能提供了资源。

利益冲突声明

已声明的资助方信息

美国国立卫生研究院,美国国立普通医学科学研究所 ,R01GM150468 ,R35GM142884

美国国立卫生研究院院内研究项目,美国国家癌症研究所 ,ZIA-BC011977

加拿大卫生研究院, https://ror.org/01gavpb45 ,PJT-580631

美国国立卫生研究院, https://ror.org/01cwqze88 ,T32GM142607 ,T32CA009138

美国癌症协会 ,34102-PF-19-128-01-DDC

Boettcher基金会Webb-Waring生物医学研究奖

明尼苏达大学癌症靶点培训项目

版权

本预印本的,允许其永久展示该预印本。

该内容依据 CC-BY-NC-ND 4.0国际许可协议 提供。

返回顶部

上一篇

下一篇

发布于2026年10月2日。

下载PDF

补充材料

电子邮件

感谢您有兴趣传播bioRxiv上的内容。

您的电子邮件地址

*

您的姓名

*

发送至

*

请输入多个地址,每行一个,或使用逗号分隔。

您即将发送以下内容

人类CCR4–NOT复合体在mRNA去腺苷酸化与降解中的全局调控功能

邮件主题

(您的姓名)已从bioRxiv向您转发一个页面

邮件正文

(您的姓名)认为您可能会对bioRxiv网站上的这一页面感兴趣。

您的个人留言

验证码

此问题用于测试您是否为人类访客,并防止自动垃圾邮件提交。

分享

人类CCR4–NOT复合体在mRNA去腺苷酸化与降解中的全局调控功能

Katherine M McKenney

、

Mika Nevo

、

Robert P Connacher

、

Khadija Rebbani

、

Zijun Luo

、

Elise B Dunshee

、

Marc R Fabian

、

Eugene Valkov

、

Justin Brumbaugh

、

Aaron C Goldstrohm

bioRxiv

2026.09.30.755734;

doi:

https://doi.org/10.64898/2026.09.30.755734

分享本文:

复制

引文工具

人类CCR4–NOT复合体在mRNA去腺苷酸化与降解中的全局调控功能

Katherine M McKenney

、

Mika Nevo

、

Robert P Connacher

、

Khadija Rebbani

、

Zijun Luo

、

Elise B Dunshee

、

Marc R Fabian

、

Eugene Valkov

、

Justin Brumbaugh

、

Aaron C Goldstrohm

bioRxiv

2026.09.30.755734;

doi:

https://doi.org/10.64898/2026.09.30.755734


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.30.755734v1?rss=1

🏷️ Ccr4-NOT复合体 mRNA去腺苷酸化 mRNA降解 聚腺苷酸尾 转录后调控 全转录组分析