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聚腺苷酸(poly(A))尾的缩短启动了mRNA降解,而人类CCR4-NOT复合体是细胞质中主要的去腺苷酸化酶。尽管其各亚基已得到鉴定,但这些亚基在细胞中的功能尚未得到全面评估。我们分别耗竭了每个CCR4-NOT亚基,并测定了其对全转录组的影响。CCR4-NOT调控来自数千个基因的转录本,其中许多转录本在细胞中与该复合体相关。不同转录本群体根据该复合体的模块化组织方式表现出不同的响应,而其中一些转录本则对特定亚基呈现独特的响应。聚腺苷酸尾分析显示,在这些细胞中,CNOT7和CNOT8去腺苷酸化酶是调控聚腺苷酸尾长度的主要因子。CCR4-NOT的靶转录本富集于包括细胞增殖、细胞凋亡、应激反应以及癌症相关过程在内的调控通路中。生物信息学分析鉴定出与CCR4-NOT调控相关的序列决定因素和候选招募因子。这些结果界定了CCR4-NOT介导的mRNA降解的广度与特异性,并为解析其调控机制及生物学作用提供了资源。
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poly(A)尾的缩短启动mRNA降解,而人类CCR4–NOT复合体是细胞质中主要的去腺苷酸化酶。尽管其各个亚基已经得到界定,但它们在细胞中的功能尚未得到全面评估。我们分别耗竭了CCR4–NOT复合体的每个亚基,并测定了其对全转录组的影响。CCR4–NOT调控来自数千个基因的转录本,其中许多转录本在细胞中与该复合体相关。不同转录本群体依据该复合体的模块化组织方式呈现出不同的响应,而其中一些亚群则表现出针对特定亚基的独特响应。poly(A)尾分析表明,在这些细胞中,CNOT7和CNOT8去腺苷酸化酶是调控poly(A)尾长度的主要因子。CCR4–NOT靶标富集于包括细胞增殖、细胞凋亡、应激反应以及癌症相关过程在内的调控通路中。生物信息学分析鉴定出与CCR4–NOT调控相关的序列决定因素和候选募集因子。这些结果界定了CCR4–NOT介导的mRNA降解的广度与特异性,并为解析其调控机制和生物学功能提供了资源。
利益冲突声明
已声明的资助方信息
美国国立卫生研究院,美国国立普通医学科学研究所 ,R01GM150468 ,R35GM142884
美国国立卫生研究院院内研究项目,美国国家癌症研究所 ,ZIA-BC011977
加拿大卫生研究院, https://ror.org/01gavpb45 ,PJT-580631
美国国立卫生研究院, https://ror.org/01cwqze88 ,T32GM142607 ,T32CA009138
美国癌症协会 ,34102-PF-19-128-01-DDC
Boettcher基金会Webb-Waring生物医学研究奖
明尼苏达大学癌症靶点培训项目
版权
本预印本的,允许其永久展示该预印本。
该内容依据 CC-BY-NC-ND 4.0国际许可协议 提供。
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发布于2026年10月2日。
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人类CCR4–NOT复合体在mRNA去腺苷酸化与降解中的全局调控功能
Katherine M McKenney
、
Mika Nevo
、
Robert P Connacher
、
Khadija Rebbani
、
Zijun Luo
、
Elise B Dunshee
、
Marc R Fabian
、
Eugene Valkov
、
Justin Brumbaugh
、
Aaron C Goldstrohm
bioRxiv
2026.09.30.755734;
doi:
https://doi.org/10.64898/2026.09.30.755734
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人类CCR4–NOT复合体在mRNA去腺苷酸化与降解中的全局调控功能
Katherine M McKenney
、
Mika Nevo
、
Robert P Connacher
、
Khadija Rebbani
、
Zijun Luo
、
Elise B Dunshee
、
Marc R Fabian
、
Eugene Valkov
、
Justin Brumbaugh
、
Aaron C Goldstrohm
bioRxiv
2026.09.30.755734;
doi:
https://doi.org/10.64898/2026.09.30.755734
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.30.755734v1?rss=1
🏷️ Ccr4-NOT复合体 mRNA去腺苷酸化 mRNA降解 聚腺苷酸尾 转录后调控 全转录组分析