3,034个酿酒酵母基因组的突变谱区分出格鲁吉亚葡萄酒群体

不同种群之间的突变谱存在差异，而要全面认识这种变异，需要进行广泛采样并采用精细尺度的种群分辨率。在本研究中，我们基于一个经过统一处理、涵盖全球采样的3,034个酿酒酵母（*Saccharomyces cerevisiae*）基因组集合，以及包含此前采样的全球1,011个基因组集合的扩展数据集，刻画了单核苷酸多态性和小型插入缺失所反映的突变谱。此前在1,011个基因组中报道的主要突变谱模式，在扩展数据集中仍然清晰可见，其中包括非洲啤酒菌株显著的突变谱分化。在更精细的种群分辨率下，我们发现了与葡萄酒相关种群之间的其他变异，包括一种与格鲁吉亚葡萄酒相关的信号；该信号在稀有变异中最为显著，因此与突变过程发生相对近期变化的解释一致。进一步地，我们采用考虑序列背景的分类方法，对3,034个天然酵母基因组中的小型插入缺失特征进行了刻画。总体而言，我们的分析表明，扩大采样范围并细化种群划分，能够更全面地揭示酿酒酵母种内突变谱的变异。

不同群体之间的突变谱存在差异，而要全面认识这种差异，需要进行广泛采样并采用精细尺度的群体分辨率。在本研究中，我们从一组经过统一处理、涵盖全球采样的3,034个酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）基因组中，对单核苷酸多态性以及小型插入和缺失进行了突变谱分析，并构建了一个扩展数据集，其中纳入了此前采样的全球1,011个基因组数据集。此前在1,011个基因组中报道的主要突变谱模式，在扩展数据集中仍然明显存在，其中包括非洲啤酒菌株显著的突变谱分化。在更精细的群体分辨率下，我们发现了葡萄酒相关群体之间的其他变异，其中包括一种与格鲁吉亚葡萄酒相关的信号；该信号在稀有变异中最为显著，因此与突变过程发生相对较近期的变化相一致。我们进一步应用一种考虑序列背景的分类方法，对3,034个天然酵母基因组中的小型插入缺失谱进行了表征。总体而言，我们的分析表明，扩大采样范围并细化群体划分，能够更全面地揭示酿酒酵母（S. cerevisiae）内部突变谱的变异。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.28.755217v1?rss=1

🏷️ 酿酒酵母 突变谱 群体基因组学 单核苷酸多态性 小型插入缺失 葡萄酒相关种群