转录适应影响必需旁系同源基因家族之间的缓冲作用

旁系同源基因之间的缓冲是一种已得到充分描述的现象，其中遗传冗余赋予了遗传稳健性。旁系同源基因之间的功能共享，使得当一个或多个旁系同源基因家族成员失活时能够产生补偿效应。鉴于转录适应在影响高度同源基因之间的基因表达方面所发挥的作用，我们试图确定转录适应是否参与旁系同源基因缓冲。我们对110个旁系同源基因敲除进行了Perturb-seq分析，并评估了旁系同源基因之间以及整个转录组水平上的补偿性基因表达效应。该分析鉴定出6对旁系同源基因：当其中一个旁系同源基因发生CRISPR介导的丧失后，这些基因对会发生转录适应。进一步研究发现，旁系同源基因TIAL1丧失后，TIA1的上调依赖于无义介导的mRNA降解，以及通过转运蛋白IPO8介导的主动核导入。这些数据对转录适应进行了全面评估，并表明转录适应在人类旁系同源基因中反复出现，但并非普遍存在。

旁系同源基因之间的缓冲是一种已有充分描述的现象，其中遗传冗余赋予了遗传稳健性。旁系同源基因之间的功能共享，使得当旁系同源基因家族中的一个或多个基因失活时能够产生补偿效应。鉴于转录适应在影响高度同源基因之间的基因表达中所发挥的作用，我们试图确定转录适应是否参与旁系同源基因缓冲。我们对110个旁系同源基因进行了基于Perturb-seq的敲除，并评估了旁系同源基因之间以及全转录组水平上的补偿性基因表达效应。该分析鉴定出6对旁系同源基因：当其中一个旁系同源基因经CRISPR介导丧失后，这些基因对会发生转录适应。此外，我们发现，旁系同源基因TIAL1丧失后TIA1的上调依赖于无义介导的降解以及通过importin IPO8介导的主动核导入。这些数据对转录适应进行了全面评估，并表明转录适应在人类旁系同源基因中具有重复发生性，但并非普遍存在。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.24.754217v1?rss=1

🏷️ 转录适应 旁系同源基因 遗传冗余 基因表达调控 无义介导的mRNA降解 Perturb-seq