多种生物学参考背景下高危神经母细胞瘤的昼夜节律基因网络失调

背景：昼夜节律钟调控细胞稳态，其紊乱被认为与侵袭性神经母细胞瘤相关，尤其见于携带 MYCN 扩增的肿瘤。然而，目前尚不清楚这种改变是否仅限于单个生物钟基因，还是扩展至昼夜节律基因网络的协同调控。因此，我们在多种生物学背景下考察了不良预后神经母细胞瘤中的昼夜节律钟网络紊乱。 方法：采用 Delta-CCD 评估昼夜节律基因网络失调情况，分析两个神经母细胞瘤队列中的肿瘤样本（SEQC，n=498；Kocak，n=649），并在经典参考、肾上腺组织匹配参考和发育参考三种背景下，比较与结局相关的临床特征。通过跨队列荟萃分析和逐一排除单个基因的分析评估结果的稳健性。采用校正临床协变量的 Cox 比例风险模型，评估单个生物钟基因表达与患者结局之间的关联。 结果：在两个队列中，无论采用何种参考背景，被归类为高风险的肿瘤（高风险定义因研究而异）均表现出最高的 Delta-CCD。MYCN 扩增肿瘤呈现出更依赖参考背景的模式，其中在肾上腺组织背景下最为显著；4 期肿瘤表现出相似但较弱的模式。进一步分析支持高风险相关信号体现为分布式的网络层面改变，而非由单个基因现象所致。 结论：高风险神经母细胞瘤的特征是，在经典参考和组织匹配参考背景下，昼夜节律钟基因网络协同组织结构发生稳健紊乱，这种紊乱超越了单个生物钟基因的改变。昼夜节律失调的程度取决于所采用的参考状态。

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🏷️ 昼夜节律基因网络 神经母细胞瘤 MYCN扩增 肿瘤风险分层 基因表达网络失调