在何种情况下，无标记形态学足以实现靶向细胞测量

无标记形态学能够捕捉细胞响应，但其能否替代靶向细胞测量取决于预期用途。我们利用覆盖1,000个基因敲除、52种荧光报告器和73个A549筛选实验的近1,000万组配对相位成像—报告器观测，评估测量的充分性。在留出的视野、基因和筛选实验中，10种预测器的恢复能力存在差异。同一细胞配对对照表明，除扰动平均值和已测量协变量之外，还存在与报告器状态相关的信息。尽管预测响应幅度的变异性降低，扰动排序通常仍得以保留。对于留出的基因敲除响应，预测结果保留了最强命中中位数79%的结果，而功能术语的保留程度则有所不同。基于图谱的判据为固定集成模型识别出30种定量代理指标和7种排序代理指标，但参考结果的可重复性限制了对这些结果的解读。在独立的原代肝细胞数据中，针对217种留出化合物，明场图像预测优先识别出了实测代谢活性损失最大的11种化合物中的10种。因此，测量的充分性取决于目标、预测器、情境和科学任务，而不能仅由预测相关性决定。

无标记形态学能够捕捉细胞响应，但其能否替代靶向细胞测量取决于预期用途。我们利用来自1,000个基因敲除、52种荧光报告器和73个A549筛选实验的近1,000万组配对相位—报告器观测，评估测量充分性。在留出的视野、基因和筛选实验中，10种预测器的恢复能力存在差异。同一细胞配对对照鉴定出超越扰动平均值和已测协变量的报告器状态信息。尽管预测响应幅度的变异性降低，扰动排序通常仍得以保留。在留出的基因敲除响应预测中，最强命中项的中位保留率为79%，而功能术语的保留情况则有所不同。基于图谱得到的判据为固定集成模型识别出30个定量代理指标和7个排序代理指标，但参考结果的可重复性限制了其解释。于独立的原代肝细胞数据中，在217种留出化合物中，明场预测优先识别出了实测代谢活性损失最大的11种化合物中的10种。因此，测量充分性取决于目标、预测器、实验情境和科学任务，而不能仅由预测相关性决定。

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🏷️ 无标记形态学 细胞表型筛选 相位成像 荧光报告器预测 基因敲除筛选