缺失正性转录延伸因子b(P-TEFb)组分细胞周期蛋白T1(CycT1)的细胞中,高度诱导性转录受到损害

由 root 提交于 周二, 09/29/2026 - 10:47
在真核细胞中,正性转录延伸因子 b(P-TEFb)在促进 RNAPII 从暂停状态转变为活跃转录状态的过程中发挥着关键作用。尽管三种不同的细胞周期蛋白(Cyc)T(CycT1、T2a 和 T2b)均可与 CDK9 相互作用并形成具有功能的 P-TEFb,但大多数 P-TEFb 复合物由 CycT1 和 CDK9 组成。为分析 P-TEFb 的 CycT1 亚基对细胞转录的作用,我们构建了缺失 CycT1 蛋白的 HEK293T 细胞(CycT1-KO 细胞)。尽管 CycT1-KO 细胞未表现出明显的生长缺陷,但 CDK9 水平有所降低,且未观察到 CycT2 的代偿性过表达,这表明降低后的功能性 P-TEFb 复合物水平仍足以维持细胞正常生长。报告基因检测表明,PMA 诱导的 NF-κB 依赖性转录在 CycT1-KO 细胞中受到抑制,尽管 NF-κB(P65)本身的功能并未受到影响。另一方面,PMA 诱导的 AP-1 依赖性反式激活在 CycT1-KO 细胞中未受影响。此外,JQ1(一种强效的 P-TEFb 诱导剂)刺激的转录在 CycT1-KO 细胞中也有所降低。生化分析数据显示,含有 CycT1 的 P-TEFb(P-TEFb(CDK9:CycT1))可被 JQ1 高效地从 7SK snRNP 中释放,而 P-TEFb(CDK9:CycT2)则不受 JQ1 影响。转录组分析表明,CycT1 缺失对稳态转录的影响较小。然而,JQ1 依赖性基因在 CycT1-KO 细胞中的表达却显著降低。有趣的是,对 33 种不同类型癌症的基因表达谱进行分析发现,排名前 13 位的 JQ1 依赖性基因中有 11 个在胰腺腺癌中同样呈现高水平上调。基于上述结果,我们得出结论:尽管许多基因可同时受到 P-TEFb(CDK9:CycT1)和 P-TEFb(CDK9:CycT2)的调控,但 CycT1 在调控高度诱导型基因方面发挥着关键作用,而这些基因在某些特定类型的癌症中也存在异常调控。

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缺失正性转录延伸因子 b(P-TEFb)Cyclin T1(CycT1)的细胞中高度诱导性转录受损。

Takuya Kajitani , Fang Huang , Kenji Nishiura , Dan Irwin , Aung Chein , 查看 ORCID 资料 Koh Fujinaga

doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.26.754677

Takuya Kajitani 1 加州大学旧金山分校;

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通讯作者: koh.fujinaga{at}ucsf.edu

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在真核细胞中,正性转录延伸因子 b(P-TEFb)在促进 RNA 聚合酶 II(RNAPII)由暂停状态转变为活跃转录模式的过程中发挥关键作用。尽管三种不同的 Cyclin T(CycT)(CycT1、T2a 和 T2b)均可与 CDK9 相互作用并形成具有功能的 P-TEFb,但大多数 P-TEFb 复合物由 CycT1 和 CDK9 组成。为分析 P-TEFb 的 CycT1 亚基对细胞转录的作用,我们建立了缺失 CycT1 蛋白的 HEK293T 细胞(CycT1-KO 细胞)。尽管 CycT1-KO 细胞未表现出明显的生长缺陷,但 CDK9 水平降低,且未观察到 CycT2 的代偿性过表达,这表明较低水平的功能性 P-TEFb 复合物已足以维持细胞正常生长。报告基因分析表明,PMA 诱导的 NF-κB 依赖性转录在 CycT1-KO 细胞中受损,尽管 NF-κB(P65)本身的功能并未受到影响。另一方面,PMA 诱导的 AP-1 依赖性反式激活在 CycT1-KO 细胞中未受影响。此外,JQ1(一种强效的 P-TEFb 诱导剂)刺激的转录在 CycT1-KO 细胞中有所降低。生化分析数据显示,含 CycT1 的 P-TEFb(P-TEFb(CDK9:CycT1))可被 JQ1 高效地从 7SKsnRNP 中释放,而 P-TEFb(CDK9:CycT2)则不受 JQ1 影响。转录组分析表明,CycT1 的缺失对稳态转录的影响较小。然而,JQ1 依赖性基因的表达在 CycT1-KO 细胞中显著降低。有趣的是,参照 33 种不同癌症类型的基因表达谱发现,排名前 13 位的 JQ1 依赖性基因中有 11 个在胰腺腺癌中同样高度上调。基于这些结果,我们得出结论:尽管许多基因可同时受到 P-TEFb(CDK9:CycT1)和 P-TEFb(CDK9:CycT2)的调控,但 CycT1 在调控高度诱导性基因方面发挥关键作用,而这些基因在某一特定类型的癌症中也存在异常调控。

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已声明的基金信息

Nora Eccles Treadwell 基金会, https://ror.org/028zcv790 ,R01AI167778

Nora Eccles Treadwell 基金会, https://ror.org/028zcv790 ,P0560541

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发表于 2026 年 9 月 28 日。

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Takuya Kajitani , Fang Huang , Kenji Nishiura , Dan Irwin , Aung Chein , Koh Fujinaga

bioRxiv 2026.09.26.754677; doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.26.754677

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缺失正性转录延伸因子 b(P-TEFb)Cyclin T1(CycT1)的细胞中高度诱导性转录受损。

Takuya Kajitani , Fang Huang , Kenji Nishiura , Dan Irwin , Aung Chein , Koh Fujinaga

bioRxiv 2026.09.26.754677; doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.26.754677


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.26.754677v1?rss=1

🏷️ P-TEFb复合物 细胞周期蛋白T1 RNA聚合酶II转录延伸 JQ1诱导转录 高度诱导型基因 胰腺腺癌