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遗传变异会影响生物体对化学和环境暴露的反应,导致个体在抗性或易感性方面存在差异。对遗传多样性细胞群体开展正向遗传筛选,可用于鉴定驱动反应差异的具体遗传变异。来自实验室小鼠遗传参考群体(如多样性远交群体(Diversity Outbred,DO))的细胞系具有良好的遗传定位效能。多样性干细胞面板对于研究三苯基磷酸酯(triphenyl phosphate,TPHP)等化学暴露的早期发育效应尤为有益。TPHP是一种与不良发育效应相关的有机磷阻燃剂,包括改变干细胞的细胞周期。自我更新和多能性是发育过程中干细胞的标志性特征;因此,了解TPHP等化学物质如何改变这些关键特征十分重要。为更深入地了解遗传变异对TPHP暴露反应的影响,我们采用了一个遗传多样性DO诱导多能干细胞(DO induced pluripotent stem cells,DO iPSCs)面板。通过差异基因表达分析和表达数量性状位点(expression quantitative trait locus,eQTL)定位,我们的分析刻画了不同细胞系间的基因表达变异。我们鉴定出多个促成TPHP暴露后基因表达变异的基因组位点,其中包括位于15号染色体上的一个调控热点。基因集富集分析显示,TPHP可影响多条通路,包括脂质代谢、类固醇激素信号传导和细胞周期。我们的研究表明,遗传变异能够调节TPHP对干细胞基因表达和细胞周期的影响。此外,本研究还表明,DO iPSC资源等遗传多样性细胞面板为鉴定化学毒性遗传决定因素提供了一种易于实施且具有可扩展性的方法。
阻燃剂磷酸三苯酯在遗传多样性小鼠诱导多能干细胞中诱导不同反应 | bioRxiv
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# 阻燃剂磷酸三苯酯在遗传多样性小鼠诱导多能干细胞中诱导不同反应
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Laura G. Reinholdt
doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.28.754846
Madison Armstrong 1 塔夫茨大学;
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通讯作者: madison.armstrong{at}jax.org
Kathryn Janeczko 2 杰克逊实验室;
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Anne Czechanski 3 杰克逊实验室
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## 摘要
遗传变异会影响机体对化学物质和环境暴露的生物学反应,从而导致个体在抵抗性或易感性方面存在差异。对遗传多样性细胞群体开展正向遗传学筛选,可用于鉴定驱动反应差异的具体遗传变异。来自实验室小鼠遗传参考群体(如多样性远交系群体(Diversity Outbred,DO))的细胞系具有较强的遗传定位能力。多样化的干细胞组尤其适用于研究磷酸三苯酯(triphenyl phosphate,TPHP)等化学物质暴露所产生的早期发育效应。TPHP 是一种有机磷阻燃剂,与多种不良发育效应相关,包括干细胞细胞周期的改变。自我更新和多能性是发育过程中干细胞的定义性特征;因此,了解TPHP等化学物质可能如何改变这些关键特征十分重要。为更好地理解遗传变异对TPHP暴露反应的影响,我们利用了一个由遗传多样性DO诱导多能干细胞(DO iPSC)组成的细胞组。我们通过差异基因表达分析和表达数量性状位点(expression quantitative trait locus,eQTL)定位,表征了不同细胞系之间的基因表达变异。我们鉴定出多个促成TPHP暴露后基因表达变异的基因组位点,其中包括位于15号染色体上的一个调控热点。基因集富集分析显示,TPHP影响了多个通路,包括脂质代谢、类固醇激素信号传导和细胞周期。我们的研究表明,遗传变异能够调节TPHP对干细胞基因表达和细胞周期的影响。此外,本研究还证明,DO iPSC资源等遗传多样性细胞组为鉴定化学毒性遗传决定因素提供了一种易于实施且可扩展的方法。
## 利益冲突声明
## 资助者信息声明
美国国家癌症研究所, https://ror.org/040gcmg81 ,P30CA034196
杰克逊实验室, https://ror.org/021sy4w91 ,U42OD010921
## 版权
本预印本的。
保留所有权利。未经许可不得重复使用。
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发布于2026年9月28日。
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Callan O'Connor
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Laura G. Reinholdt
bioRxiv 2026.09.28.754846; doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.28.754846
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Whitney Martin
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Selcan B Aydin
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Steven C Munger
,
Laura G. Reinholdt
bioRxiv 2026.09.28.754846; doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.28.754846
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.28.754846v1?rss=1
🏷️ 三苯基磷酸酯 诱导多能干细胞 遗传多样性 eQTL定位 化学毒性 细胞周期