宿主遗传因素决定小肠中乳杆菌科菌群的命运

先天性模式识别受体结合的是由不同微生物类群共同拥有的进化保守结构，而对亲缘关系密切的微生物的调控可能基于不同的机制，并且容易受到宿主遗传变异的影响。尽管人们日益认识到宿主遗传因素对肠道微生物组组成的影响，但要理解调控单个细菌谱系的多态性机制，仍需要采用复杂的研究方法。利用以鼠李糖乳杆菌属（Ligilactobacillus murinus，ASF361）单菌定植的悉生小鼠，我们发现，C57BL/6J（B6）小鼠肠道内的ASF361（或其他乳杆菌科属的细菌）数量显著高于BALB/cJ（BALB/c）小鼠。ASF361丰度的差异与适应性免疫及细菌毒性因子无关。在B6小鼠中，ASF361定植于回肠隐窝，黏附相关分子的表达水平更高，并且碳水化合物代谢通路的表达更为富集；而在BALB/c小鼠中，ASF361大多保持在肠腔内，其与饥饿和应激相关基因的表达更为富集。这些发现凸显了宿主遗传变异在塑造微生物定植过程中的重要性，并提示在评估益生菌菌株和进行微生物群移植时，应考虑这种遗传变异。

尽管先天性模式识别受体能够结合由不同微生物群体共同拥有的进化保守性结构，但对亲缘关系密切的微生物的调控可能基于不同的原理，并且可能受到宿主遗传变异的影响。尽管人们日益认识到宿主遗传因素对肠道微生物组组成的影响，但要理解调控个体细菌谱系的多态性机制，仍需要采用复杂的研究方法。我们利用单独定植Ligilactobacillus murinus（ASF361）的悉生小鼠进行研究，发现C57BL/6J（B6）小鼠肠道内的ASF361（或其他乳杆菌科属细菌）数量显著高于BALB/cJ（BALB/c）小鼠。ASF361丰度的差异与适应性免疫及细菌毒性因素无关。在B6小鼠中，ASF361定植于回肠隐窝，黏附相关分子的表达更高，并且碳水化合物代谢通路的表达更加丰富；而在BALB/c小鼠中，ASF361主要滞留于肠腔内，其与饥饿和应激相关基因的表达更加丰富。这些发现凸显了宿主遗传变异在塑造微生物定植过程中的重要性，并提示在评估益生菌菌株和开展微生物群移植时，应考虑这种遗传差异。

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