采用统一基因分型命名法研究2013—2022年欧洲猪甲型流感病毒的遗传多样性与系统地理学

猪流感A病毒（swIAV）持续对人类和动物的健康构成威胁。本研究全面分析了2013年至2022年欧洲猪流感A病毒的遗传多样性及其演化。为弥补现有分类体系的不足，研究开发了一种基于Nextclade、易于使用的全基因组分型工具，并建立了全球命名体系。将该工具应用于欧洲序列数据后，研究发现了前所未有的遗传多样性，成功鉴定出150种猪流感A病毒基因型，这些基因型混合了猪源和人源的基因片段。贝叶斯系统地理学模型结合经济数据表明，育肥用活断奶仔猪的贸易推动了猪流感A病毒在欧洲各国之间的跨境传播。研究还在多个欧洲国家检测到反复发生的人传猪反向人畜共患事件。这些发现清楚地凸显了商品猪流动在病毒传播中的作用，并强调了开展协调一致的基因组监测、追踪猪流感A病毒演化以及为全球大流行前防范策略提供信息的关键重要性。

猪流感A病毒（swIAV）持续对人类和动物健康构成威胁。本研究系统分析了2013年至2022年欧洲猪流感A病毒的遗传多样性与进化过程。为弥补现有分类体系的不足，研究团队开发了一种基于Nextclade、易于获取的全基因组分型工具，并建立了全球命名体系。将该工具应用于欧洲序列数据后，研究揭示了前所未有的遗传多样性，成功鉴定出150种猪流感A病毒基因型，这些基因型混合了猪源和人源病毒片段。贝叶斯系统地理学模型结合经济数据表明，用于育肥的活体断奶仔猪贸易推动了猪流感A病毒在欧洲跨境传播。研究还在多个欧洲国家发现了反复发生的人传猪反向人畜共患事件。这些发现清楚地凸显了商品猪调运在病毒传播中的作用，并强调了开展协调一致的基因组监测的重要性，以追踪猪流感A病毒的进化，为全球大流行前防范策略提供依据。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.21.753142v1?rss=1

🏷️ 猪流感A病毒 遗传多样性 全基因组分型 系统地理学 跨境传播 反向人畜共患