白色念珠菌生物膜调控网络中的两类 Ume6 靶基因

由 root 提交于 周五, 09/25/2026 - 12:47
真菌病原体白色念珠菌(*Candida albicans*)形成生物膜是感染的重要来源。生物膜调控因子 Ume6 与其协同转录因子 Efg1、Ndt80 和 Upc2 形成复合物,驱动生物膜相关基因的表达。本文展示了在野生型和 efg1Δ/Δ ndt80Δ/Δ upc2Δ/Δ 背景下,Ume6 与染色质结合的染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)数据。Ume6 与两类启动子区域结合。对于其中一类,在 efg1Δ/Δ ndt80Δ/Δ upc2Δ/Δ 背景下,Ume6 的结合显著降低。该类别包括 577 个基因,其中许多基因已被证实在生物膜形成或相关的丝状化过程中发挥作用。对于第二类,在三重突变体背景下,Ume6 的结合未受到影响。该类别包括 534 个基因,其中一些基因参与铁稳态(如 SFU1)和麦角固醇合成(如 ERG11),这可能有助于解释 Ume6 对 ndt80Δ/Δ 突变体唑类药物敏感性的影响。该类别还包括 FLO9,这是一个推定的黏附素基因,对于 efg1Δ/Δ ndt80Δ/Δ 双突变体产生的新生生物膜状态是必需的。数据表明,Ume6 与约一半靶基因的结合需要已知协同因子的参与,而与另外约一半靶基因的结合则不需要这些因子。Ume6 可能在不依赖任何协同因子的情况下与后一组启动子区域结合,或者可能与其他尚未发现的协同因子共同结合。

aaron.mitchell{at}uga.edu

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真菌病原体白色念珠菌(*Candida albicans*)形成生物膜是感染的重要来源。生物膜调控因子 Ume6 与伙伴转录因子 Efg1、Ndt80 和 Upc2 形成复合物,驱动生物膜相关基因的表达。持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。

本预印本依据 CC BY 4.0 国际许可协议提供。

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发布于 2026 年 9 月 24 日。

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Eunsoo Do, Joel McManus, Aaron P. Mitchell

bioRxiv 2026.09.24.753443; doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.24.753443

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Eunsoo Do,Joel McManus,Aaron P. Mitchell

bioRxiv 2026.09.24.753443; doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.24.753443


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.24.753443v1?rss=1

🏷️ 白色念珠菌 生物膜形成 Ume6转录因子 协同转录因子 ChIP-seq 唑类药物敏感性