红海灰红树的叶部和根部微生物组特征

红树林在强烈的环境约束下仍能持续存在，这得益于微生物的支持。尽管不同红树林组分中的微生物群落存在差异，但其组装机制及组分特异性的功能特征仍缺乏深入解析。在本研究中，我们将肽核酸夹闭技术与16S rRNA基因扩增子测序和基因组分辨率宏基因组学相结合，研究了红海灰红树叶片和根部相关微生物群落。结果表明，同质选择和均质化扩散是叶片微生物群落组装的关键过程。该叶际栖息着新颖的原核生物谱系，其中部分成员可能能够合成视紫红质、植物多糖降解酶以及γ-氨基丁酸；后者是一种能够提高植物耐盐胁迫能力的代谢物。地下部分富集了隶属于脱硫杆菌目（Desulfobacterales）和沉积杆菌科（Sedimenticolaceae）的基因组，表明其具有互补性的硫循环和氮循环能力，这与其他蓝碳生态系统中的情况相似。与米草根部来源的基因组进行比较后发现，宿主驱动的选择作用促成了沉积杆菌科物种的富集，并使其呈现趋同的代谢特征。总体而言，本研究整合性地揭示了灰红树的微生物生物学特征，为理解其地上—地下微生物组的多样性、生态学及可预测功能提供了基础性认识。

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摘要

红树林在强烈的环境限制下仍能存续，这离不开微生物的支持。尽管不同红树林微环境中的微生物群落存在差异，但其组装机制及具有微环境特异性的功能特征仍缺乏清晰认识。在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。

该文根据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可 提供。

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发布于 2026 年 9 月 23 日。

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《红海灰色红树的叶片和根部微生物组特征》

Diego J Jimenez

Tahira Jamil

Maria F Pena-Valencia

Hanin Alzubaidy

Azad Baazeem

Kaitlyn O'Toole

Lucas W Mendes

Susana Carvalho

Alexandre S Rosado

bioRxiv 2026.09.22.753136； doi： https://doi.org/10.64898/2026.09.22.753136

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Diego J Jimenez

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Hanin Alzubaidy

Azad Baazeem

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Lucas W Mendes

Susana Carvalho

Alexandre S Rosado

bioRxiv 2026.09.22.753136； doi： https://doi.org/10.64898/2026.09.22.753136

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.22.753136v1?rss=1

🏷️ 红树林微生物组 叶际微生物群落 根际微生物群落 群落组装机制 宏基因组学 硫氮循环