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由蛋白水解靶向嵌合体(PROteolysis TArgeting Chimeras,PROTACs)介导的蛋白质降解是一个复杂、动态且包含多个步骤的过程。PROTACs的结构多样性,加之细胞异质性,使得该过程的每个阶段都存在显著差异。因此,亟需一种简便而全面的方法,以有效解析这些机制。现有用于评估PROTAC降解作用的方法通常耗时、耗力或成本高昂,而且许多方法只能反映整个降解过程的局部信息。因此,通常需要结合多种互补性检测方法,才能获得完整的图景。在此,我们采用市售的靶向细胞周期蛋白依赖性激酶6(Cyclin-dependent Kinase 6,CDK6)的PROTACs进行示范,表明一种简便、单步、无需洗涤、无添加剂的基于GFP的活细胞成像方法,能够在受控报告系统中快速生成动态降解指标(Dmax、Rmax、TDmax、CDmax、DC50、Km、Tmax、Kdeg、Vmax、DT50、τ和TRmax),用于比较和排序不同PROTACs。该方法具有快速的检测周转时间、优异的检测性能以及与高通量(HT)检测格式的良好兼容性,将有助于快速识别候选化合物,并可作为候选化合物向先导化合物优化过程中的指导性检测方法。
超越 Dmax 和 DC50:评估 PROTAC 介导的复杂动力学降解过程的简便工具 | bioRxiv
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# 超越 Dmax 和 DC50:评估 PROTAC 介导的复杂动力学降解过程的简便工具
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Smitha Kizhake , Amarnath Natararajan
doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.18.752745
Smitha Kizhake 辛辛那提大学
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发布于 2026 年 9 月 22 日。
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Smitha Kizhake , Amarnath Natararajan
bioRxiv 2026.09.18.752745; doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.18.752745
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Smitha Kizhake , Amarnath Natararajan
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📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.18.752745v1?rss=1
🏷️ PROTAC蛋白降解 蛋白降解动力学 活细胞成像 高通量筛选 CDK6靶向降解
来源出处
超越Dmax和DC50:评估PROTAC介导的复杂动力学降解过程的简易工具
https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.18.752745v1?rss=1