富含成纤维细胞的转录组轴反映了结直肠癌CMS4表型中的基质重塑

总体肿瘤表达特征既可反映细胞组成，也可反映肿瘤细胞程序。我们利用11个基因表达综合数据库（Gene Expression Omnibus，GEO）队列、TCGA COAD/READ数据集以及E-MTAB-12862，对结直肠癌中的一个固定的等权重87基因评分进行了评估。在GEO数据中（1,783例肿瘤；441例疾病进展相关事件），评分每增加1个标准差对应的风险比为1.33（95%置信区间，1.19–1.49）。在7个无病生存队列中，该估计值相近。在376例TCGA肿瘤中，针对无进展间期的风险比为1.25（1.03–1.52）。在E-MTAB-12862中，该关联未能重复验证：在948例I–III期肿瘤中，共发生436例无复发生存事件，风险比为1.05（0.95–1.16）。固定评分与CMS4、癌症相关成纤维细胞及基质相关指标存在相关性。基质重塑模块单独产生的GEO估计值与完整评分相近，而去除该模块后，这一关联减弱。在校正已测得的CMS4和基质成分后，组成残差化分析未发现额外的预后信息。单细胞和空间分析将该基因程序定位于富含成纤维细胞的区室。该87基因评分主要反映CMS4中一个富含成纤维细胞、参与基质重塑的成分，而非一个独立的预后亚型。其预后关联在不同队列之间存在差异，现有证据不支持将其用于临床。

整体肿瘤表达特征既可反映细胞组成，也可反映肿瘤细胞程序。我们利用11个基因表达综合数据库（Gene Expression Omnibus，GEO）队列、TCGA COAD/READ数据集以及E-MTAB-12862，对结直肠癌中的一个固定的、各基因等权重的87基因评分进行了评估。在GEO数据集中（1,783例肿瘤；441例进展相关事件），评分每增加1个标准差对应的风险比为1.33（95%置信区间：1.19–1.49）。在7个无病生存队列中，该估计值相近。在376例TCGA肿瘤中，进展间期的风险比为1.25（1.03–1.52）。该关联在E-MTAB-12862中未能重复：在948例I–III期肿瘤中，共发生436例无复发生存事件，风险比为1.05（0.95–1.16）。该固定评分与CMS4、癌症相关成纤维细胞及基质相关指标呈相关性。基质重塑模块在GEO中产生了与完整评分相近的估计结果，而去除该模块后，这一关联减弱。在校正测得的CMS4和基质成分后，对细胞组成进行残差化处理未发现额外的预后信息。单细胞和空间分析将该基因程序定位于富含成纤维细胞的区室。该87基因评分主要反映CMS4中一个富含成纤维细胞、参与基质重塑的成分，而非一种独立的预后亚型。其预后关联在不同队列之间存在差异，现有证据不支持其临床应用。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.18.752659v1?rss=1

🏷️ 结直肠癌 CMS4分型 癌症相关成纤维细胞 基质重塑 转录组学 单细胞与空间分析