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Azospirillum 是一属固氮的 α-变形菌，其基因组由一条染色体和数个大型次级复制子组成。这些复制子的组织方式和进化过程仍知之甚少。我们分析了22个完整的 Azospirillum 基因组，这些基因组包含6～10个复制子，并对其基因组成、复制、分配及二聚体解析系统进行了表征。最大的复制子包含大多数必需基因，即为染色体。其他复制子可根据基因组成、质粒复制蛋白 RepA 的相似性以及 ParAB 分配蛋白的相似性进行分类。总体而言，采用不同方法获得的分组结果彼此一致。对基因组成的分析还发现了次级复制子的融合或分裂现象。Azospirillum 菌株的所有大型次级复制子均不含 repABC 复制系统，而全部属于迭代子质粒。针对各复制子组，均预测了 RepA box 基序以及质粒复制起点 oriV 的结构。大多数复制子利用 ParABS 系统进行分配。在少数情况下，某复制子含有来自一个组的 repA 和来自另一组的 parAB。parAB 操纵子相对于复制起点的位置由 parAB 所属组别决定，而不是由 repA 决定。大多数次级复制子显然利用依赖 FtsK 的二聚体解析途径，而非依赖染色体编码的 XerCD 蛋白。在大多数情况下，所鉴定的 dif 基序无法区分不同的复制子组。
Azospirillum 属是一类固氮 α-变形菌，其基因组由一条染色体和数个大型次级复制子组成。这些复制子的组织与演化仍缺乏深入了解。我们分析了22个完整的 Azospirillum 基因组，这些基因组包含6至10个复制子，并对其基因组成、复制、分离以及二聚体解析系统进行了表征。
最大的复制子包含大多数必需基因，即为染色体。其他复制子可依据基因组成、质粒复制蛋白 RepA 的相似性以及 ParAB 分离蛋白的相似性进行分类。总体而言，采用不同方法获得的分组结果彼此一致。对基因组成的分析还鉴定出了次级复制子的融合或分裂现象。
Azospirillum 菌株的所有大型次级复制子均不含 repABC 复制系统，而全部属于迭代子质粒。对于各复制子分组，均预测了 RepA box 基序以及质粒复制起点 oriV 的结构。
大多数复制子利用 ParABS 系统进行分离。在少数情况下，复制子含有来自一个分组的 repA，以及来自另一分组的 parAB。parAB 操纵子相对于复制起点的位置由 parAB 分组决定，而非由 repA 决定。
大多数次级复制子显然利用依赖 FtsK 的二聚体解析途径，而是依赖染色体编码的 XerCD 蛋白。在大多数情况下，所鉴定的 dif 基序无法区分不同的复制子分组。
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📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.14.751567v1?rss=1
🏷️ 固氮螺菌 质粒复制 次级复制子 染色体组织 ParABS分配系统 细菌基因组进化
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