BATOseq-PE:一个公开的鳐形类DNA文库,为秘鲁海洋鳐类的隐存多样性、遗传健康状况与管理提供了首批分子层面的认识

由 root 提交于 周二, 09/22/2026 - 18:47
鳐形类(鳐、魟及其近缘类群)是全球受威胁最严重的软骨鱼类之一,然而秘鲁类群的分子多样性仍未得到充分评估。此外,锯鳐、蝠鲼和鬼蝠鲼等具有高度保护优先级的类群,其区域性条形码序列往往仅限于私人记录,从而阻碍了必要的系统地理学和种群结构评估。为弥补这一空白,我们构建了 BATOseq-PE,这是首个面向秘鲁海洋鳐形类的公共遗传参考数据库,涵盖从当地标本中通过体外测序获得的14个物种,并补充了一个针对 Notoraja martinezi 新近开展的计算机组装线粒基因组。该开放获取数据库贡献了73条新的 COI 条形码序列,在15个分子操作分类单元(MOTUs)和条形码索引号(BINs)中提供了稳健的分类学分辨率。值得注意的是,我们首次提供了 Mobula munkiana、Mobula thurstoni、Myliobatis peruviana 和 Rostroraja velezi 等高优先级物种的秘鲁公共记录,并首次公开了 N. martinezi 和 Zapteryx xyster 的全球条形码记录。通过将 BATOseq-PE 与全球数据集相结合,我们首次对秘鲁鳐形类开展了多类群筛查,用于物种界定和系统地理学评估,结果揭示了 R. velezi 内部存在一个隐蔽谱系,并发现了提示 Mobula mobular 存在雌性归巢行为的遗传连通性模式。最后,我们将核苷酸多样性与生态和渔业数据相结合,纳入遗传多样性风险指标(GDRI),发现了一种令人担忧的趋势:高强度捕捞压力与灭绝风险及遗传多样性耗竭相互重叠;据此,我们提出了基于数据且具有针对性的管理策略。BATOseq-PE 是一项宝贵资源,可加速分类学和种群评估,最终通过将遗传学框架整合进渔业管理,促进鳐形类保护。

鳐形类群(包括魟、鳐及其近缘类群)是全球受威胁最严重的软骨鱼类之一,然而秘鲁类群的分子多样性仍缺乏充分评估。此外,锯鳐、蝠鲼和鬼蝠鲼等具有高度保护优先性的类群,其区域性条形码序列通常仅限于私人记录,从而阻碍了必要的系统地理学和种群结构评估。为弥补这一空白,我们构建了 BATOseq-PE,这是首个面向秘鲁海洋鳐形类群的公共遗传参考数据库,涵盖从当地标本中通过体外测序获得的 14 个物种,并补充了一个针对 Notoraja martinezi 新近进行计算机组装的线粒体基因组。该开放获取数据库贡献了 73 条新获得的 COI 条形码,在 15 个分子操作分类单元(MOTUs)和条形码索引号(BINs)层面提供了稳健的分类分辨率。值得注意的是,我们首次提供了 Mobula munkiana、Mobula thurstoni、Myliobatis peruviana 和 Rostroraja velezi 等高优先级物种在秘鲁的公共记录,以及 N. martinezi 和 Zapteryx xyster 在全球范围内的首批公共条形码记录。通过将 BATOseq-PE 与全球数据集相结合,我们首次对秘鲁鳐形类群开展了多类群界定和系统地理学评估,揭示了 R. velezi 内部存在一个隐蔽谱系,并发现了表明 Mobula mobular 具有雌性定域性行为的遗传连通性模式。最后,我们将核苷酸多样性与生态和渔业数据相结合,纳入遗传多样性风险指标(GDRI)进行分析,发现了一个令人担忧的趋势:高强度捕捞压力与灭绝风险及遗传多样性耗竭相互重叠。据此,我们提出了以数据为基础、针对性更强的管理策略。BATOseq-PE 是一项宝贵资源,可加速分类学和种群评估,并最终通过将遗传学框架整合进渔业管理,促进鳐形类群的保护。


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.15.751127v1?rss=1

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