系统性红斑狼疮的单细胞多祖源调控图谱

整合患者队列的基因组学与单细胞转录组学特征，可以揭示遗传关联背后的调控效应及其与疾病的关系。在此，我们介绍了 SLEmap，这是一张基于来自 281 例系统性红斑狼疮（SLE）患者外周血单个核细胞构建的多祖源单细胞表达数量性状位点（sc-eQTL）图谱。我们在 5,656 个基因中鉴定出 18,608 个相互独立的 eQTL，其中 66 个基因的 149 个信号与 SLE 全基因组关联研究（GWAS）位点发生共定位。近一半的共定位仅通过细胞类型水平的分析得以检测到，凸显了细胞环境对于解读疾病相关遗传变异的重要性。多祖源数据鉴定出在不同祖源背景下均具有稳健性的调控信号，并提高了信号解析度。在健康人群队列（OneK1K）的 sc-eQTL 中，大多数共定位信号无法被检测到；新发现的 SLE 共定位信号揭示了不同细胞类型中的疾病相关调控机制，包括 NF-κB 通路。这些发现表明，疾病特异性、多祖源的单细胞调控图谱对于解析疾病相关遗传变异背后的基因及细胞机制具有重要价值。

整合患者队列的基因组和单细胞转录组图谱，可以揭示遗传变异与疾病关联背后的调控效应。在此，我们介绍了SLEmap：一项基于281例系统性红斑狼疮（SLE）患者外周血单个核细胞构建的多祖源单细胞表达数量性状位点（sc-eQTL）图谱。我们在5,656个基因中鉴定出18,608个独立的eQTL，其中66个基因中的149个信号与SLE全基因组关联研究（GWAS）位点发生共定位。近一半的共定位仅通过细胞类型水平的分析得以检测到，凸显了细胞背景对于解读疾病相关遗传变异的重要性。多祖源数据鉴定出了在不同祖源背景中均具有稳健性的调控信号，并提高了信号解析度。在健康人群队列（OneK1K）的sc-eQTL中，大多数共定位无法被检测到；新发现的SLE共定位揭示了不同细胞类型中的疾病相关调控机制，包括NF-κB通路。这些发现表明，疾病特异性、多祖源的单细胞调控图谱对于解析疾病相关遗传变异所涉及的基因及细胞机制具有重要价值。

NdK目前受雇于阿斯利康；除审阅最终稿件外，其对本项工作的所有贡献均在受雇于该公司之前完成，且阿斯利康未参与本研究的设计、数据收集、分析或发表决定。EH为百时美施贵宝公司的员工。SM为葛兰素史克公司的员工。FN曾任赛诺菲员工，目前为Deerfield公司首席执行官。EdR为赛诺菲公司员工。

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🏷️ 系统性红斑狼疮 单细胞转录组学 多祖源遗传学 单细胞表达数量性状位点 基因调控 全基因组关联研究